More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1847 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  69.57 
 
 		 797 aa  1145    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  64.18 
 
 		 798 aa  1028    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 807 aa  1649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  63.29 
 
 		 798 aa  1021    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  32.22 
 
 		 785 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  31.05 
 
 		 774 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  30.21 
 
 		 790 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  30.17 
 
 		 781 aa  350  7e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  29.81 
 
 		 781 aa  344  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  27.42 
 
 		 777 aa  313  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  27.89 
 
 		 852 aa  300  7e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  31.86 
 
 		 874 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 773 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  30.06 
 
 		 779 aa  251  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  30.19 
 
 		 750 aa  251  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  28.26 
 
 		 762 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  28.13 
 
 		 753 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  29.16 
 
 		 753 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 756 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 753 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  29.74 
 
 		 758 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  28.3 
 
 		 754 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  29.63 
 
 		 758 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  30.13 
 
 		 773 aa  243  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  28.92 
 
 		 801 aa  243  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  27.8 
 
 		 775 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  31.2 
 
 		 745 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  28.72 
 
 		 785 aa  239  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  28.46 
 
 		 761 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  28.11 
 
 		 788 aa  237  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  30.89 
 
 		 755 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  28.68 
 
 		 773 aa  234  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  30.76 
 
 		 746 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  30.76 
 
 		 755 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  27.69 
 
 		 772 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  30.61 
 
 		 798 aa  231  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  27.48 
 
 		 855 aa  218  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  31.48 
 
 		 757 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  30.63 
 
 		 766 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  30.46 
 
 		 766 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  27.39 
 
 		 855 aa  211  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  31.47 
 
 		 766 aa  210  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  31.47 
 
 		 766 aa  208  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  25.48 
 
 		 619 aa  178  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  30.65 
 
 		 495 aa  177  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  31.61 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.89 
 
 		 676 aa  160  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25.75 
 
 		 588 aa  153  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  39.41 
 
 		 754 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  27.64 
 
 		 670 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  39.65 
 
 		 766 aa  147  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  28.78 
 
 		 712 aa  144  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  26.99 
 
 		 654 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  26.93 
 
 		 669 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  39.39 
 
 		 766 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  39.39 
 
 		 766 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  40.52 
 
 		 790 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  27.76 
 
 		 617 aa  137  8e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  33.33 
 
 		 739 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.92 
 
 		 634 aa  105  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  30.3 
 
 		 790 aa  104  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.34 
 
 		 582 aa  99.4  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  25.53 
 
 		 722 aa  97.8  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  31.27 
 
 		 806 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  28.53 
 
 		 787 aa  95.9  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  24.66 
 
 		 723 aa  94  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  21.27 
 
 		 726 aa  92.4  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  24.67 
 
 		 729 aa  91.3  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  25.21 
 
 		 541 aa  90.9  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  23.28 
 
 		 723 aa  90.1  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  24.87 
 
 		 807 aa  85.5  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  24.61 
 
 		 806 aa  84.7  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  28.63 
 
 		 739 aa  84  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  23.79 
 
 		 668 aa  82  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.02 
 
 		 710 aa  81.6  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  24.41 
 
 		 646 aa  80.5  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.11 
 
 		 952 aa  79.7  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  22.86 
 
 		 674 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.19 
 
 		 714 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  22.55 
 
 		 669 aa  76.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  24.96 
 
 		 653 aa  75.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  22.31 
 
 		 636 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  29 
 
 		 691 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  22.86 
 
 		 773 aa  75.1  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  26.48 
 
 		 583 aa  74.7  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  22.39 
 
 		 681 aa  74.7  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  22.15 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  22.15 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  22.15 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  22.15 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  22.15 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  22.15 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  25 
 
 		 788 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  23.56 
 
 		 645 aa  73.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.26 
 
 		 690 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  29.51 
 
 		 714 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.51 
 
 		 714 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  23.22 
 
 		 832 aa  73.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1828  helicase c2  28.46 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147958  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  22.98 
 
 		 665 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>