More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0984 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  60.31 
 
 		 754 aa  941    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  58.62 
 
 		 753 aa  895    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  59.69 
 
 		 762 aa  895    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  59.31 
 
 		 788 aa  894    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  60.55 
 
 		 756 aa  947    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  64.4 
 
 		 761 aa  972    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  64.61 
 
 		 775 aa  987    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  58.85 
 
 		 779 aa  912    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  62.39 
 
 		 766 aa  944    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  59.89 
 
 		 746 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  59.41 
 
 		 798 aa  874    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  62.37 
 
 		 772 aa  977    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  59.23 
 
 		 766 aa  874    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  51.87 
 
 		 855 aa  791    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  53.94 
 
 		 785 aa  786    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  60.37 
 
 		 755 aa  860    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  60.29 
 
 		 745 aa  882    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  69.99 
 
 		 801 aa  1098    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  60.44 
 
 		 754 aa  939    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  58 
 
 		 773 aa  860    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  59.23 
 
 		 766 aa  870    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  58.36 
 
 		 757 aa  857    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  59.48 
 
 		 766 aa  872    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  64.1 
 
 		 758 aa  974    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  60.13 
 
 		 766 aa  880    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  64.14 
 
 		 758 aa  971    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  60.37 
 
 		 755 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  59.23 
 
 		 766 aa  870    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  59.69 
 
 		 753 aa  899    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  60 
 
 		 766 aa  879    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  58.9 
 
 		 753 aa  900    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  62.89 
 
 		 773 aa  896    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  51.58 
 
 		 855 aa  791    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  56.77 
 
 		 790 aa  801    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  49.54 
 
 		 750 aa  714    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 773 aa  1568    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  58.5 
 
 		 495 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  58.41 
 
 		 431 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  35.32 
 
 		 774 aa  459  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  33.51 
 
 		 790 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  34.32 
 
 		 785 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  32.3 
 
 		 781 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.91 
 
 		 781 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  31.44 
 
 		 777 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 852 aa  335  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  30.9 
 
 		 798 aa  272  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 807 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  29.58 
 
 		 798 aa  263  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  29.65 
 
 		 797 aa  259  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.04 
 
 		 676 aa  139  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.93 
 
 		 669 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.65 
 
 		 588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  25 
 
 		 670 aa  121  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  35.02 
 
 		 874 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  26.53 
 
 		 654 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.28 
 
 		 712 aa  118  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  26.4 
 
 		 617 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.93 
 
 		 739 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.79 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.9 
 
 		 550 aa  91.7  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  28.84 
 
 		 619 aa  89.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  22.76 
 
 		 634 aa  85.9  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  29.85 
 
 		 790 aa  85.1  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  24.43 
 
 		 773 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.86 
 
 		 582 aa  83.2  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  21.15 
 
 		 726 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  26.16 
 
 		 643 aa  80.5  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.66 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  22.76 
 
 		 791 aa  76.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  24.07 
 
 		 723 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  29.88 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  23.83 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.07 
 
 		 806 aa  72.8  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  23.61 
 
 		 729 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  34.16 
 
 		 917 aa  71.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.15 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  27.56 
 
 		 640 aa  70.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  25.87 
 
 		 669 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  22.91 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  27.46 
 
 		 614 aa  67.8  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  20.77 
 
 		 835 aa  66.6  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  24.71 
 
 		 782 aa  66.6  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  20.48 
 
 		 938 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  21.14 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  25.77 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.33 
 
 		 707 aa  64.3  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  20.03 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  25.38 
 
 		 669 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.8 
 
 		 691 aa  63.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  27.24 
 
 		 849 aa  63.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  28.45 
 
 		 588 aa  62.4  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  26.25 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  25.6 
 
 		 722 aa  62.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  22.86 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.43 
 
 		 921 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.73 
 
 		 929 aa  62.4  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.1 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  29.07 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  30.63 
 
 		 658 aa  61.2  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  26.05 
 
 		 788 aa  60.8  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>