63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1013 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  100 
 
 		 588 aa  1192    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  71.94 
 
 		 583 aa  842    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  68.76 
 
 		 640 aa  782    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  64.22 
 
 		 644 aa  733    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  65.65 
 
 		 614 aa  793    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  24.17 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1524  helicase c2  26.38 
 
 		 657 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00208913 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0015  helicase c2  26.38 
 
 		 655 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0747117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0007  helicase c2  25.59 
 
 		 653 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000554419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  24.91 
 
 		 807 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  24.63 
 
 		 797 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  21.58 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  22.49 
 
 		 801 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  21.26 
 
 		 781 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  28.45 
 
 		 773 aa  62  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  25.22 
 
 		 798 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  28.57 
 
 		 723 aa  60.5  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  24.78 
 
 		 798 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  26.69 
 
 		 766 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.88 
 
 		 691 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  21.25 
 
 		 753 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.22 
 
 		 938 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.07 
 
 		 712 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  23.38 
 
 		 758 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  22.28 
 
 		 574 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  26.39 
 
 		 782 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 750 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  30.42 
 
 		 790 aa  51.6  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.43 
 
 		 619 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  27.98 
 
 		 787 aa  50.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  25.97 
 
 		 746 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  30.39 
 
 		 749 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  25.97 
 
 		 755 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  25.97 
 
 		 755 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  28.83 
 
 		 654 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  21.88 
 
 		 762 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  25.86 
 
 		 779 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  26.84 
 
 		 722 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  24.27 
 
 		 798 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  22.04 
 
 		 753 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  22.36 
 
 		 785 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  20.72 
 
 		 537 aa  48.5  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  29.46 
 
 		 806 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  22.6 
 
 		 765 aa  48.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  21.85 
 
 		 761 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  23.49 
 
 		 793 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  24 
 
 		 773 aa  48.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  22.17 
 
 		 758 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  24.14 
 
 		 691 aa  47.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  25.54 
 
 		 745 aa  47.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.85 
 
 		 710 aa  47  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  25.54 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  27.81 
 
 		 1067 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  25.54 
 
 		 431 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.47 
 
 		 978 aa  47  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  21.79 
 
 		 774 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  23.53 
 
 		 669 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  31.47 
 
 		 874 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1828  helicase c2  30 
 
 		 688 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147958  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1900  helicase c2  30 
 
 		 688 aa  44.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  22.49 
 
 		 773 aa  44.3  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  26 
 
 		 669 aa  44.3  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  26.47 
 
 		 791 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>