191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1376 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  100 
 
 		 431 aa  872    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  98.61 
 
 		 746 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  93.74 
 
 		 745 aa  808    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  72.9 
 
 		 754 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  98.61 
 
 		 755 aa  864    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  99.07 
 
 		 755 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  99.77 
 
 		 495 aa  870    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  71.46 
 
 		 754 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  68.68 
 
 		 756 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  70.36 
 
 		 766 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  69.91 
 
 		 766 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  70.36 
 
 		 766 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  70.36 
 
 		 766 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  69.68 
 
 		 757 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  70.14 
 
 		 766 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  69.46 
 
 		 766 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  58.41 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  61.34 
 
 		 790 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  57.24 
 
 		 762 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  57.24 
 
 		 753 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  57.31 
 
 		 753 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  56.61 
 
 		 773 aa  492  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  56.05 
 
 		 772 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  57.48 
 
 		 753 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  58.24 
 
 		 766 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  54.88 
 
 		 788 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  56.77 
 
 		 855 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  54.67 
 
 		 801 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  56.98 
 
 		 758 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  55.86 
 
 		 779 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  56.38 
 
 		 758 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  56.34 
 
 		 855 aa  477  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  54.78 
 
 		 775 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  55.24 
 
 		 761 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  54.88 
 
 		 785 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  56.09 
 
 		 773 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  54.15 
 
 		 798 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  49.07 
 
 		 750 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  34.33 
 
 		 774 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  32.2 
 
 		 790 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  32.57 
 
 		 785 aa  239  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  32.27 
 
 		 777 aa  229  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  29.98 
 
 		 781 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  33.03 
 
 		 852 aa  223  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  29.53 
 
 		 781 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  33.41 
 
 		 798 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  33.18 
 
 		 798 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  31.76 
 
 		 797 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  31.61 
 
 		 807 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  34.52 
 
 		 874 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.09 
 
 		 676 aa  120  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 712 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  26.52 
 
 		 670 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  27.09 
 
 		 669 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.27 
 
 		 654 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  27.33 
 
 		 739 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  29.27 
 
 		 773 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.11 
 
 		 617 aa  87.4  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  25.74 
 
 		 619 aa  87  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  27.99 
 
 		 790 aa  84.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  22.57 
 
 		 726 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.37 
 
 		 806 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  31.11 
 
 		 723 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  23.98 
 
 		 588 aa  73.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  26.73 
 
 		 664 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  27.57 
 
 		 729 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  28.62 
 
 		 787 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  29.91 
 
 		 722 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.57 
 
 		 712 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  23.83 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  26.64 
 
 		 782 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.3 
 
 		 934 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.3 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  21.39 
 
 		 793 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.94 
 
 		 582 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  21.98 
 
 		 788 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  25.58 
 
 		 669 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  25.19 
 
 		 669 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  26.29 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.9 
 
 		 934 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  26.3 
 
 		 674 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  26.69 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  25.19 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  25.36 
 
 		 849 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  31.85 
 
 		 658 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  24.81 
 
 		 669 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.34 
 
 		 707 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.4 
 
 		 666 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.12 
 
 		 725 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  28.3 
 
 		 684 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.11 
 
 		 934 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.11 
 
 		 934 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.2 
 
 		 938 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.11 
 
 		 934 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.11 
 
 		 934 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.11 
 
 		 934 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  23.74 
 
 		 574 aa  53.9  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  27.44 
 
 		 699 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.72 
 
 		 934 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  28.36 
 
 		 710 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>