More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1217 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  46.01 
 
 		 785 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  96.93 
 
 		 781 aa  1533    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  100 
 
 		 781 aa  1578    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  44.4 
 
 		 790 aa  680    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  40.8 
 
 		 774 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  41.27 
 
 		 777 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  38.43 
 
 		 852 aa  555  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  31.89 
 
 		 756 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  31.85 
 
 		 753 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 753 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  31.6 
 
 		 762 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  31.83 
 
 		 779 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  31.47 
 
 		 753 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  31.44 
 
 		 772 aa  429  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  31.81 
 
 		 754 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  31.98 
 
 		 754 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  31.45 
 
 		 766 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 773 aa  422  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  32.85 
 
 		 758 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  31.45 
 
 		 775 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  31.51 
 
 		 801 aa  419  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  32.64 
 
 		 758 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  31.32 
 
 		 761 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  30.79 
 
 		 745 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  31.48 
 
 		 773 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  30.2 
 
 		 773 aa  402  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  30.29 
 
 		 755 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  31.23 
 
 		 766 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  31.23 
 
 		 766 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  30.43 
 
 		 798 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  30.97 
 
 		 766 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  30.49 
 
 		 755 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  31.24 
 
 		 750 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  31.03 
 
 		 790 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  30.91 
 
 		 757 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  30.35 
 
 		 746 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  30.59 
 
 		 766 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  30.3 
 
 		 785 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  29.73 
 
 		 788 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  30.88 
 
 		 766 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  30.88 
 
 		 766 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  27.63 
 
 		 855 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  27.63 
 
 		 855 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  30.17 
 
 		 807 aa  350  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  30.59 
 
 		 797 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  29.89 
 
 		 798 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  28.99 
 
 		 798 aa  330  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  26.23 
 
 		 874 aa  250  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  29.35 
 
 		 495 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  29.53 
 
 		 431 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.89 
 
 		 676 aa  169  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25 
 
 		 712 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  27.4 
 
 		 619 aa  163  9e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.62 
 
 		 588 aa  152  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  28.41 
 
 		 654 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  23.61 
 
 		 669 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  23.31 
 
 		 670 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.08 
 
 		 582 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  24.57 
 
 		 617 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  26.26 
 
 		 580 aa  123  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  25.15 
 
 		 739 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  25.41 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  24.04 
 
 		 726 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  24.66 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  24.04 
 
 		 575 aa  105  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  23.57 
 
 		 938 aa  104  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  22.83 
 
 		 634 aa  103  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  21.51 
 
 		 723 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  30.42 
 
 		 790 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  21.39 
 
 		 729 aa  96.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  22.35 
 
 		 723 aa  94.4  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  22.13 
 
 		 799 aa  92.4  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  21.42 
 
 		 641 aa  90.9  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  22.47 
 
 		 917 aa  89  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  26.6 
 
 		 773 aa  88.6  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.22 
 
 		 806 aa  87.4  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  29.85 
 
 		 787 aa  87.4  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  23.33 
 
 		 550 aa  86.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  26.94 
 
 		 641 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.82 
 
 		 714 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  22.45 
 
 		 641 aa  84  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.26 
 
 		 714 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.82 
 
 		 714 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  23.42 
 
 		 662 aa  83.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.34 
 
 		 720 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  23.02 
 
 		 668 aa  83.2  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  22.08 
 
 		 643 aa  82.4  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.87 
 
 		 714 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.11 
 
 		 714 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  22.26 
 
 		 641 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.66 
 
 		 674 aa  81.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.52 
 
 		 690 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  28.51 
 
 		 698 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.61 
 
 		 690 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  22.61 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  22.71 
 
 		 646 aa  79  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  22.86 
 
 		 788 aa  78.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  22.15 
 
 		 651 aa  78.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  29.05 
 
 		 645 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  20.91 
 
 		 670 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>