281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2510 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  56.82 
 
 		 766 aa  833    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  59.14 
 
 		 756 aa  903    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  58.16 
 
 		 755 aa  829    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  58.28 
 
 		 762 aa  872    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  61.46 
 
 		 758 aa  909    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  59.43 
 
 		 761 aa  908    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  56.31 
 
 		 790 aa  783    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  58.29 
 
 		 755 aa  833    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  59.82 
 
 		 775 aa  926    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  63.46 
 
 		 773 aa  924    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  52.86 
 
 		 785 aa  777    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  58.41 
 
 		 779 aa  924    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  58.12 
 
 		 746 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  57.07 
 
 		 754 aa  886    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  59.43 
 
 		 772 aa  928    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  57.07 
 
 		 766 aa  844    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  57.93 
 
 		 745 aa  844    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  59.11 
 
 		 801 aa  888    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  60.37 
 
 		 766 aa  892    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  58.37 
 
 		 754 aa  896    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  57.01 
 
 		 757 aa  829    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  56.94 
 
 		 773 aa  853    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  57.76 
 
 		 753 aa  877    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  56.82 
 
 		 766 aa  829    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  58.41 
 
 		 753 aa  875    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  50.75 
 
 		 855 aa  773    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  57.2 
 
 		 766 aa  836    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  56.56 
 
 		 766 aa  828    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  61.43 
 
 		 758 aa  912    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  100 
 
 		 788 aa  1595    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  56.82 
 
 		 766 aa  829    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  49.09 
 
 		 750 aa  718    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  56.64 
 
 		 753 aa  867    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  60.61 
 
 		 798 aa  898    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  59.44 
 
 		 773 aa  909    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  50.64 
 
 		 855 aa  773    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  56.68 
 
 		 495 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  54.88 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  35.26 
 
 		 774 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  31.28 
 
 		 790 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  32.22 
 
 		 785 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  29.85 
 
 		 781 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  29.6 
 
 		 781 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  28.5 
 
 		 777 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  30.81 
 
 		 852 aa  321  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  28.36 
 
 		 807 aa  244  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  27.64 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  31.02 
 
 		 798 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  31.18 
 
 		 798 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  37.3 
 
 		 874 aa  127  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  27.67 
 
 		 654 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.67 
 
 		 617 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 		 676 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  26.45 
 
 		 670 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.11 
 
 		 712 aa  107  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  22.36 
 
 		 619 aa  107  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  26.37 
 
 		 669 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  25.73 
 
 		 739 aa  97.8  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25.17 
 
 		 588 aa  94.7  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  28.74 
 
 		 790 aa  85.9  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.09 
 
 		 574 aa  85.1  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.4 
 
 		 773 aa  80.9  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  22.41 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  27.84 
 
 		 787 aa  75.5  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  19.64 
 
 		 550 aa  75.5  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  24.93 
 
 		 673 aa  73.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  25 
 
 		 726 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  24.01 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.66 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  21.49 
 
 		 788 aa  71.2  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  24.56 
 
 		 690 aa  70.9  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  29.31 
 
 		 806 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  25.71 
 
 		 692 aa  69.7  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.72 
 
 		 580 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  26.27 
 
 		 669 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  24.29 
 
 		 806 aa  67  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.91 
 
 		 707 aa  65.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  25.49 
 
 		 669 aa  64.7  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  24.9 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  22.29 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  21.85 
 
 		 722 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  24.2 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  29.21 
 
 		 661 aa  62.4  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  32.89 
 
 		 917 aa  61.2  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  24.39 
 
 		 652 aa  61.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  31.06 
 
 		 674 aa  61.2  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  22.2 
 
 		 644 aa  60.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  31.06 
 
 		 633 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  25.23 
 
 		 650 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  31.06 
 
 		 659 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  30.9 
 
 		 659 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.64 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  24.32 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.65 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  25.04 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.17 
 
 		 690 aa  59.3  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  28.32 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  23.66 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  30.26 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  23 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>