More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4133 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 798 aa  1627    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  94.61 
 
 		 798 aa  1526    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  64.18 
 
 		 807 aa  1045    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  66.17 
 
 		 797 aa  1108    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  30.85 
 
 		 785 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  29.19 
 
 		 790 aa  347  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  31.64 
 
 		 774 aa  340  9e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  29.11 
 
 		 781 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  29.51 
 
 		 781 aa  333  7.000000000000001e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  27.28 
 
 		 777 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  30.2 
 
 		 852 aa  289  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  32.46 
 
 		 874 aa  282  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  30.9 
 
 		 773 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  29.55 
 
 		 801 aa  263  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  31.03 
 
 		 798 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  29.82 
 
 		 766 aa  250  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  30.06 
 
 		 754 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  29.05 
 
 		 758 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  29.69 
 
 		 750 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  29.53 
 
 		 758 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  29.3 
 
 		 754 aa  248  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  28.62 
 
 		 785 aa  247  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  28.24 
 
 		 775 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  27.78 
 
 		 761 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  28.37 
 
 		 772 aa  239  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  29.74 
 
 		 756 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  33.22 
 
 		 745 aa  238  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  30.09 
 
 		 773 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 753 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  32.14 
 
 		 773 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  33.22 
 
 		 755 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  30.89 
 
 		 788 aa  234  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  33.05 
 
 		 746 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  33.05 
 
 		 755 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  27.74 
 
 		 779 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  28.53 
 
 		 753 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  28.57 
 
 		 762 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  28.77 
 
 		 753 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  28.75 
 
 		 855 aa  224  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  30.69 
 
 		 766 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  30.69 
 
 		 757 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  30.53 
 
 		 766 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  28.21 
 
 		 855 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  29.9 
 
 		 790 aa  216  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  31.3 
 
 		 766 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  26.87 
 
 		 619 aa  189  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  31.83 
 
 		 495 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  33.18 
 
 		 431 aa  180  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  27.86 
 
 		 588 aa  161  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  38.11 
 
 		 766 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  37.7 
 
 		 766 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  37.7 
 
 		 766 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  26.52 
 
 		 670 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.04 
 
 		 676 aa  144  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  29.04 
 
 		 654 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.76 
 
 		 617 aa  134  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  25.77 
 
 		 634 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  27.71 
 
 		 712 aa  131  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  24.66 
 
 		 669 aa  127  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  26.77 
 
 		 739 aa  126  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  24.19 
 
 		 723 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  35.02 
 
 		 787 aa  110  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  34.1 
 
 		 790 aa  110  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.88 
 
 		 582 aa  107  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  25.35 
 
 		 723 aa  106  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  25.15 
 
 		 739 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  26.54 
 
 		 722 aa  105  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  32.1 
 
 		 806 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  25.12 
 
 		 574 aa  102  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  24.16 
 
 		 788 aa  100  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  22.21 
 
 		 799 aa  100  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  24.78 
 
 		 541 aa  99  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  23.41 
 
 		 575 aa  99.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  25.31 
 
 		 729 aa  98.6  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  24.47 
 
 		 807 aa  89.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.12 
 
 		 580 aa  86.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  25.41 
 
 		 917 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  24.29 
 
 		 668 aa  85.1  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  27.03 
 
 		 782 aa  83.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  25.79 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.56 
 
 		 710 aa  78.2  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  23.67 
 
 		 773 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.51 
 
 		 690 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  30 
 
 		 806 aa  75.1  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.95 
 
 		 952 aa  74.7  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  25.11 
 
 		 675 aa  73.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.51 
 
 		 690 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.51 
 
 		 690 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.51 
 
 		 690 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  20.82 
 
 		 938 aa  72.4  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  24.08 
 
 		 791 aa  72  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  24.14 
 
 		 647 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  21.19 
 
 		 707 aa  71.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.09 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.09 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.09 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.66 
 
 		 690 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.66 
 
 		 690 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.97 
 
 		 692 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.09 
 
 		 691 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>