More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1408 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  44.53 
 
 		 790 aa  683    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  100 
 
 		 781 aa  1577    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  96.93 
 
 		 781 aa  1533    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  46.91 
 
 		 785 aa  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  41.44 
 
 		 774 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  41.66 
 
 		 777 aa  589  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  41.58 
 
 		 852 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  32.55 
 
 		 756 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  32.46 
 
 		 753 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 753 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  32.25 
 
 		 762 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  32.77 
 
 		 754 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  32.22 
 
 		 779 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  31.7 
 
 		 772 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  32.2 
 
 		 754 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  32.12 
 
 		 753 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  32.2 
 
 		 766 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  33.64 
 
 		 758 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  33.68 
 
 		 758 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  32.3 
 
 		 773 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  31.71 
 
 		 775 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  31.58 
 
 		 761 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  31.46 
 
 		 773 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  31.18 
 
 		 745 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  31.51 
 
 		 801 aa  412  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  30.81 
 
 		 755 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  30.81 
 
 		 798 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  31.84 
 
 		 766 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  31.01 
 
 		 755 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  31.74 
 
 		 766 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  31.74 
 
 		 766 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  31.28 
 
 		 790 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  30.88 
 
 		 746 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  30.2 
 
 		 773 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  31.5 
 
 		 750 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  30.82 
 
 		 785 aa  399  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  30.98 
 
 		 766 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  31.3 
 
 		 757 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  29.73 
 
 		 788 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  31.27 
 
 		 766 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  31.27 
 
 		 766 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  27.63 
 
 		 855 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  27.63 
 
 		 855 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 797 aa  346  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 807 aa  344  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  30.12 
 
 		 798 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  28.86 
 
 		 798 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  29.75 
 
 		 495 aa  248  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  25.79 
 
 		 874 aa  247  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  29.98 
 
 		 431 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  27.39 
 
 		 619 aa  162  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.85 
 
 		 676 aa  159  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.89 
 
 		 712 aa  157  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  28.41 
 
 		 654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25.71 
 
 		 588 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.97 
 
 		 669 aa  140  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.06 
 
 		 582 aa  137  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  24.78 
 
 		 670 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  24.5 
 
 		 617 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  26.76 
 
 		 580 aa  126  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.95 
 
 		 739 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  25.26 
 
 		 574 aa  118  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  24.12 
 
 		 726 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  24.83 
 
 		 541 aa  113  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.17 
 
 		 634 aa  108  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  24.45 
 
 		 575 aa  107  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  23.2 
 
 		 938 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  22.46 
 
 		 723 aa  99  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  30.19 
 
 		 790 aa  99  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  21.83 
 
 		 641 aa  95.9  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  23.33 
 
 		 641 aa  94.7  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.92 
 
 		 550 aa  90.5  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  21.92 
 
 		 723 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  21.72 
 
 		 799 aa  89.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.2 
 
 		 773 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  23.66 
 
 		 668 aa  89.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  21.92 
 
 		 729 aa  89.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.91 
 
 		 714 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.91 
 
 		 714 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  30.08 
 
 		 787 aa  88.6  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.61 
 
 		 714 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  22.82 
 
 		 917 aa  87.8  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.09 
 
 		 714 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.46 
 
 		 714 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.34 
 
 		 720 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.01 
 
 		 806 aa  85.5  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  22.42 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.86 
 
 		 691 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  23.99 
 
 		 669 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  28.92 
 
 		 698 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  23.42 
 
 		 662 aa  83.2  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.87 
 
 		 793 aa  81.6  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  22.56 
 
 		 643 aa  80.9  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  23.05 
 
 		 646 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  22.33 
 
 		 649 aa  80.9  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  22.55 
 
 		 651 aa  80.5  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  29.05 
 
 		 645 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.7 
 
 		 762 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  24.22 
 
 		 669 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  23 
 
 		 835 aa  79  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>