262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1812 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 617 aa  1234    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  28.14 
 
 		 619 aa  201  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  26.23 
 
 		 670 aa  171  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.77 
 
 		 712 aa  166  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.68 
 
 		 654 aa  161  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  26.36 
 
 		 669 aa  157  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.75 
 
 		 676 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  29.53 
 
 		 588 aa  145  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  25.54 
 
 		 739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  25.66 
 
 		 634 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  27.17 
 
 		 798 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  27.76 
 
 		 807 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  25.7 
 
 		 774 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  25.76 
 
 		 798 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.5 
 
 		 781 aa  133  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  24.76 
 
 		 785 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  24.57 
 
 		 781 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  23.56 
 
 		 790 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  25 
 
 		 797 aa  127  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  22.91 
 
 		 791 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  23.11 
 
 		 777 aa  124  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  21.59 
 
 		 793 aa  124  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  29.78 
 
 		 574 aa  123  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  24.88 
 
 		 785 aa  123  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  22.57 
 
 		 791 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  27.76 
 
 		 582 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  27.32 
 
 		 575 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  25.12 
 
 		 852 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  26.4 
 
 		 773 aa  117  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  25.48 
 
 		 779 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  25.33 
 
 		 766 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  27.8 
 
 		 798 aa  112  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  26.6 
 
 		 758 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  23.45 
 
 		 788 aa  110  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  23.36 
 
 		 753 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  24.45 
 
 		 723 aa  108  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  23.89 
 
 		 775 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  24.24 
 
 		 750 aa  107  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  25.92 
 
 		 762 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  26.3 
 
 		 758 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  22.54 
 
 		 772 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  25.4 
 
 		 753 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  24.96 
 
 		 761 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  23.96 
 
 		 756 aa  105  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  26.16 
 
 		 801 aa  104  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  24.23 
 
 		 753 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  24.35 
 
 		 766 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  23.86 
 
 		 754 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  23.5 
 
 		 938 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  24.19 
 
 		 766 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  24.94 
 
 		 754 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  25.62 
 
 		 580 aa  99  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  23.47 
 
 		 723 aa  97.4  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  24.09 
 
 		 766 aa  97.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  24.38 
 
 		 766 aa  97.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  24.38 
 
 		 766 aa  97.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  25.05 
 
 		 745 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  23.17 
 
 		 722 aa  96.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  30.54 
 
 		 790 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  25.79 
 
 		 755 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  24.17 
 
 		 729 aa  94.4  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  25.57 
 
 		 746 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  31.73 
 
 		 874 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  25.57 
 
 		 755 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  28.44 
 
 		 855 aa  92  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  28 
 
 		 855 aa  90.9  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  29.96 
 
 		 757 aa  90.1  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  25.59 
 
 		 550 aa  89  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  22.69 
 
 		 773 aa  89.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  25.34 
 
 		 495 aa  89  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  25.11 
 
 		 431 aa  87.4  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  23.7 
 
 		 739 aa  86.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  21.81 
 
 		 669 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  23.81 
 
 		 799 aa  84.3  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  24.66 
 
 		 766 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  28.69 
 
 		 773 aa  81.6  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  21.96 
 
 		 773 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  22.6 
 
 		 726 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  31.36 
 
 		 790 aa  78.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  27.36 
 
 		 788 aa  75.1  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.79 
 
 		 927 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0728  helicase c2  25.95 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.884524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  31.75 
 
 		 806 aa  73.9  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  24.19 
 
 		 929 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  24.81 
 
 		 749 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  28.1 
 
 		 706 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  23.51 
 
 		 782 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  19.44 
 
 		 835 aa  69.7  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.72 
 
 		 921 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  22.86 
 
 		 841 aa  68.2  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  23.17 
 
 		 902 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.74 
 
 		 934 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.92 
 
 		 934 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.74 
 
 		 934 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.74 
 
 		 934 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.74 
 
 		 934 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.74 
 
 		 934 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  25.42 
 
 		 669 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  25.56 
 
 		 641 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>