9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0728 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0728  helicase c2  100 
 
 		 471 aa  954    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.884524  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  26.29 
 
 		 617 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  23.06 
 
 		 550 aa  53.5  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  28.57 
 
 		 669 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  28.57 
 
 		 669 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  28.57 
 
 		 669 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  23.55 
 
 		 588 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  27.62 
 
 		 669 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  23.88 
 
 		 619 aa  43.9  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>