More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0909 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  59.71 
 
 		 762 aa  871    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  58.25 
 
 		 757 aa  845    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  59.01 
 
 		 766 aa  858    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  62.01 
 
 		 761 aa  915    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  63.24 
 
 		 758 aa  913    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  51.76 
 
 		 855 aa  756    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  62.48 
 
 		 766 aa  913    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  58.92 
 
 		 754 aa  875    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  60.71 
 
 		 755 aa  836    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  59.58 
 
 		 753 aa  870    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  62.71 
 
 		 775 aa  932    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  59.32 
 
 		 779 aa  893    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  59.74 
 
 		 756 aa  890    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  60.48 
 
 		 746 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  62.09 
 
 		 772 aa  939    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  58.88 
 
 		 766 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  61.01 
 
 		 745 aa  863    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  56.33 
 
 		 790 aa  788    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  63.33 
 
 		 788 aa  939    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  60.9 
 
 		 801 aa  911    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  58.65 
 
 		 754 aa  872    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  60.08 
 
 		 773 aa  862    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  58.88 
 
 		 766 aa  854    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  59.01 
 
 		 766 aa  857    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  63.77 
 
 		 758 aa  916    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  58.88 
 
 		 766 aa  854    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  51.64 
 
 		 855 aa  761    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  60.71 
 
 		 755 aa  834    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  59.31 
 
 		 753 aa  871    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  100 
 
 		 773 aa  1549    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  58.5 
 
 		 753 aa  857    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  59.01 
 
 		 766 aa  853    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  51.05 
 
 		 750 aa  731    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  55.76 
 
 		 785 aa  791    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  70.32 
 
 		 798 aa  1047    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  63.41 
 
 		 773 aa  929    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  58.28 
 
 		 495 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  56.09 
 
 		 431 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  34.24 
 
 		 790 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  36.06 
 
 		 774 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  34.03 
 
 		 785 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  32 
 
 		 781 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.48 
 
 		 781 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  29.91 
 
 		 777 aa  395  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 852 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  30.15 
 
 		 807 aa  250  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  32.62 
 
 		 798 aa  248  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  32.62 
 
 		 798 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  29.96 
 
 		 797 aa  240  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.61 
 
 		 654 aa  138  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.64 
 
 		 669 aa  135  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  39.13 
 
 		 874 aa  134  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.38 
 
 		 676 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  27.92 
 
 		 670 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.71 
 
 		 588 aa  109  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.22 
 
 		 712 aa  108  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.44 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  21.86 
 
 		 619 aa  104  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  27.09 
 
 		 574 aa  91.3  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  23.91 
 
 		 739 aa  89.7  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  29.64 
 
 		 790 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  26.23 
 
 		 773 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  29.49 
 
 		 787 aa  82  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.38 
 
 		 582 aa  75.5  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  28.7 
 
 		 722 aa  73.9  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  21.11 
 
 		 550 aa  72.4  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  24.13 
 
 		 723 aa  71.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  27.68 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.9 
 
 		 580 aa  71.6  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  22.51 
 
 		 726 aa  70.9  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  21.22 
 
 		 541 aa  70.5  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  30.74 
 
 		 644 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.3 
 
 		 938 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  22.55 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  25.85 
 
 		 668 aa  68.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  23.83 
 
 		 661 aa  68.2  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  21.92 
 
 		 799 aa  67.8  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  34.38 
 
 		 851 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  27.42 
 
 		 683 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  18.57 
 
 		 835 aa  66.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  25.94 
 
 		 739 aa  66.6  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  25.78 
 
 		 692 aa  66.6  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  26.71 
 
 		 690 aa  66.6  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  29.24 
 
 		 645 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  27.35 
 
 		 699 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  25.51 
 
 		 765 aa  65.1  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  31.62 
 
 		 674 aa  64.7  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  31.62 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.17 
 
 		 723 aa  63.9  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  22.18 
 
 		 537 aa  63.9  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  31.62 
 
 		 659 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  25.19 
 
 		 614 aa  63.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  31.06 
 
 		 664 aa  63.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  31.62 
 
 		 659 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  29.53 
 
 		 641 aa  63.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  27.91 
 
 		 681 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  30.64 
 
 		 669 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  30.64 
 
 		 669 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  26.3 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  26.52 
 
 		 685 aa  61.6  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>