278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1737 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 574 aa  1135    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  63.87 
 
 		 575 aa  749    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  67.48 
 
 		 580 aa  819    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  61.71 
 
 		 582 aa  723    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 634 aa  280  4e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  33.1 
 
 		 588 aa  234  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  28.35 
 
 		 619 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  27.77 
 
 		 550 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  25.89 
 
 		 541 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  24.92 
 
 		 785 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  29.78 
 
 		 617 aa  123  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.71 
 
 		 676 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  24.06 
 
 		 669 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  25.41 
 
 		 781 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  25.34 
 
 		 753 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  25.26 
 
 		 781 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  24.63 
 
 		 790 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  26.4 
 
 		 537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  23.58 
 
 		 669 aa  117  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  23.7 
 
 		 669 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  25.62 
 
 		 753 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  25.25 
 
 		 762 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  25.18 
 
 		 537 aa  113  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  21.45 
 
 		 777 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  23.56 
 
 		 774 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  24.88 
 
 		 798 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 750 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  24.58 
 
 		 852 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  26.74 
 
 		 798 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.78 
 
 		 938 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  25.12 
 
 		 798 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  24.44 
 
 		 775 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  24.79 
 
 		 773 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  25.29 
 
 		 772 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  27.15 
 
 		 753 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  25.43 
 
 		 779 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  25.68 
 
 		 785 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  24.46 
 
 		 773 aa  98.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  24.13 
 
 		 761 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  25.99 
 
 		 766 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  22.9 
 
 		 754 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.86 
 
 		 712 aa  88.6  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  23.16 
 
 		 801 aa  87.8  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  24.08 
 
 		 797 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  21.27 
 
 		 841 aa  87  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  24.16 
 
 		 754 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  30.11 
 
 		 629 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  23.89 
 
 		 788 aa  85.1  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  26.53 
 
 		 758 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  24.13 
 
 		 766 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  24.13 
 
 		 766 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  24.01 
 
 		 766 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  22.61 
 
 		 654 aa  80.9  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  25.88 
 
 		 758 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  24.07 
 
 		 756 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  21.79 
 
 		 670 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  23.84 
 
 		 757 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  25.04 
 
 		 766 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  24.3 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  24.06 
 
 		 766 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  24.59 
 
 		 766 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  24.65 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  25.95 
 
 		 739 aa  77.4  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  25.06 
 
 		 669 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  25.96 
 
 		 641 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  23.94 
 
 		 745 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  21.54 
 
 		 726 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  23.99 
 
 		 723 aa  73.9  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  31.41 
 
 		 641 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.64 
 
 		 722 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  26.25 
 
 		 669 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  30.89 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  25.2 
 
 		 791 aa  70.5  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  31.45 
 
 		 674 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  26.44 
 
 		 773 aa  70.5  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  31.51 
 
 		 644 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  31.45 
 
 		 669 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  27.03 
 
 		 773 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  31.45 
 
 		 669 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.14 
 
 		 793 aa  69.7  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  31.45 
 
 		 640 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  24.27 
 
 		 723 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  30.36 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  30.77 
 
 		 659 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  24.77 
 
 		 790 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  30.83 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  30.36 
 
 		 633 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  29.81 
 
 		 790 aa  68.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  23.81 
 
 		 791 aa  68.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  31.05 
 
 		 640 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  24.02 
 
 		 670 aa  67  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  23.65 
 
 		 636 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  23.65 
 
 		 636 aa  66.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  30.36 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  22.76 
 
 		 661 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  23.65 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  23.65 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  23.65 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  23.65 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.35 
 
 		 957 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>