More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0965 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 		 676 aa  729    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  53.06 
 
 		 669 aa  725    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  51.99 
 
 		 712 aa  731    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  100 
 
 		 654 aa  1354    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  52.97 
 
 		 670 aa  732    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  32.12 
 
 		 739 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  24.54 
 
 		 785 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  29.01 
 
 		 774 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.94 
 
 		 617 aa  161  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  25.8 
 
 		 852 aa  157  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  23.42 
 
 		 722 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.69 
 
 		 619 aa  150  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  28.41 
 
 		 781 aa  150  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  28.41 
 
 		 781 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  23.29 
 
 		 739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  24.45 
 
 		 790 aa  148  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  26.99 
 
 		 807 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.86 
 
 		 726 aa  141  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  26.9 
 
 		 797 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  26.4 
 
 		 777 aa  137  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  29.04 
 
 		 798 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  28.6 
 
 		 798 aa  137  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  24.96 
 
 		 798 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  22.49 
 
 		 729 aa  134  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.39 
 
 		 723 aa  134  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  21.79 
 
 		 723 aa  130  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  26.69 
 
 		 779 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  27.56 
 
 		 762 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 753 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  26.85 
 
 		 753 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  27.67 
 
 		 788 aa  125  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  27.85 
 
 		 773 aa  124  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  26.42 
 
 		 772 aa  124  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  27.29 
 
 		 766 aa  123  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  22.73 
 
 		 773 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  25.37 
 
 		 754 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  25.05 
 
 		 785 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  26.65 
 
 		 773 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  25.27 
 
 		 754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  25.04 
 
 		 750 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  26.53 
 
 		 773 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  23.85 
 
 		 806 aa  117  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  23.78 
 
 		 782 aa  117  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  25.81 
 
 		 758 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  25.99 
 
 		 766 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  26.08 
 
 		 753 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  26 
 
 		 775 aa  113  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  25.32 
 
 		 801 aa  113  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  25.1 
 
 		 766 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  25.05 
 
 		 855 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  25.57 
 
 		 766 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  24.68 
 
 		 745 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  24.84 
 
 		 855 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  25.42 
 
 		 790 aa  110  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  30.15 
 
 		 874 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  24.9 
 
 		 766 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  25.26 
 
 		 757 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  25.48 
 
 		 755 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  25.95 
 
 		 758 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  25.48 
 
 		 755 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  25.69 
 
 		 746 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  22.93 
 
 		 788 aa  106  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  25.42 
 
 		 761 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  22.93 
 
 		 841 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  30.12 
 
 		 756 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  24.27 
 
 		 766 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  24.27 
 
 		 766 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  25.05 
 
 		 495 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  25.27 
 
 		 431 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.48 
 
 		 938 aa  101  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  29.39 
 
 		 790 aa  99.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  24.38 
 
 		 580 aa  97.4  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  23.48 
 
 		 787 aa  95.5  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.95 
 
 		 582 aa  91.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  21.52 
 
 		 835 aa  92  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  22.16 
 
 		 1067 aa  91.7  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  21.23 
 
 		 849 aa  91.3  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  28.78 
 
 		 749 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  24.22 
 
 		 807 aa  90.5  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  22.32 
 
 		 799 aa  89  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.33 
 
 		 634 aa  85.1  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  24.07 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.44 
 
 		 541 aa  83.2  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  22.61 
 
 		 574 aa  80.9  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  21.36 
 
 		 791 aa  80.9  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  23.03 
 
 		 575 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  26.07 
 
 		 791 aa  79  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  26.49 
 
 		 793 aa  78.6  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  21.25 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  22.69 
 
 		 664 aa  73.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  23.21 
 
 		 639 aa  73.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  23.08 
 
 		 649 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  22.39 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  21.91 
 
 		 644 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  23.86 
 
 		 897 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  23.86 
 
 		 897 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  23.25 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.28 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  21.36 
 
 		 849 aa  67.4  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  22.42 
 
 		 636 aa  66.6  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>