233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0816 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  63.42 
 
 		 790 aa  986    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  63.42 
 
 		 806 aa  991    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  100 
 
 		 787 aa  1581    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  43.24 
 
 		 806 aa  529  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  42.24 
 
 		 807 aa  525  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  30.03 
 
 		 723 aa  243  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  30.17 
 
 		 723 aa  231  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  29.35 
 
 		 729 aa  231  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  30.47 
 
 		 722 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  30.14 
 
 		 739 aa  216  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.51 
 
 		 773 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  26.44 
 
 		 726 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  35.02 
 
 		 798 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  25 
 
 		 739 aa  106  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.52 
 
 		 676 aa  106  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  33.98 
 
 		 798 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  24.87 
 
 		 798 aa  101  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  32.41 
 
 		 669 aa  101  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  23.48 
 
 		 654 aa  95.5  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  28.53 
 
 		 807 aa  95.9  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  27.14 
 
 		 785 aa  91.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  26.49 
 
 		 619 aa  90.9  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  30.08 
 
 		 774 aa  88.6  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  30.08 
 
 		 781 aa  88.6  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  29.85 
 
 		 781 aa  87.4  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  26.12 
 
 		 790 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  23.64 
 
 		 799 aa  85.1  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  27.08 
 
 		 670 aa  85.1  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  27.24 
 
 		 777 aa  84.3  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  29.59 
 
 		 753 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 797 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  30.1 
 
 		 773 aa  81.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  29.59 
 
 		 762 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  29.59 
 
 		 753 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.69 
 
 		 712 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  30.22 
 
 		 779 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  27.66 
 
 		 766 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  24.28 
 
 		 855 aa  77.4  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  24.28 
 
 		 855 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  25.57 
 
 		 782 aa  76.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  20.98 
 
 		 793 aa  76.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  27.84 
 
 		 788 aa  75.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 753 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  31.61 
 
 		 852 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  22.11 
 
 		 791 aa  75.1  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  28.88 
 
 		 758 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  26.91 
 
 		 756 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  25.91 
 
 		 772 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  26.62 
 
 		 775 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  28.98 
 
 		 746 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  28.72 
 
 		 745 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  28.98 
 
 		 755 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  28.98 
 
 		 755 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  26.92 
 
 		 761 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  26.15 
 
 		 773 aa  71.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  28.32 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  27.4 
 
 		 766 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  28.16 
 
 		 758 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  27.4 
 
 		 766 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  24.17 
 
 		 788 aa  68.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  27.24 
 
 		 766 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  28.37 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  28.62 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  26.9 
 
 		 766 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  30.08 
 
 		 582 aa  67.4  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  28.92 
 
 		 790 aa  67.4  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  25.82 
 
 		 647 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  28.19 
 
 		 773 aa  66.6  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  27.05 
 
 		 766 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  27.24 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  27.05 
 
 		 766 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  26.85 
 
 		 754 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  25.18 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  33.94 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  31.6 
 
 		 575 aa  63.9  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  24.63 
 
 		 801 aa  63.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  26.91 
 
 		 785 aa  62.4  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  31.36 
 
 		 645 aa  60.8  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  26.17 
 
 		 754 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  27.52 
 
 		 580 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  21.46 
 
 		 707 aa  60.1  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  27.84 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.13 
 
 		 957 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  28.26 
 
 		 662 aa  59.3  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  30.89 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.3 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  25.61 
 
 		 634 aa  57.4  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.91 
 
 		 690 aa  57.4  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.82 
 
 		 690 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  26.89 
 
 		 636 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.18 
 
 		 691 aa  56.6  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  25.33 
 
 		 639 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  29.38 
 
 		 674 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.59 
 
 		 690 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.78 
 
 		 930 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  28.66 
 
 		 652 aa  55.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  28.21 
 
 		 636 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.21 
 
 		 636 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  28.21 
 
 		 636 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  28.21 
 
 		 636 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>