117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54072 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  47.32 
 
 		 791 aa  728    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  48 
 
 		 799 aa  783    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  46.39 
 
 		 793 aa  738    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  54.91 
 
 		 788 aa  867    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  100 
 
 		 782 aa  1626    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  23.98 
 
 		 749 aa  178  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  24.32 
 
 		 791 aa  174  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  27.04 
 
 		 849 aa  165  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  25.14 
 
 		 841 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  24.93 
 
 		 849 aa  145  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  26.64 
 
 		 835 aa  124  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  23.78 
 
 		 654 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  28.16 
 
 		 1067 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  27.64 
 
 		 938 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  20.03 
 
 		 670 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  26.71 
 
 		 614 aa  110  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  22.12 
 
 		 723 aa  110  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.66 
 
 		 723 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  22.42 
 
 		 729 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  22.51 
 
 		 722 aa  101  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  22.27 
 
 		 739 aa  99.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.49 
 
 		 726 aa  92.8  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  27.34 
 
 		 739 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  24.63 
 
 		 669 aa  84  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  27.03 
 
 		 798 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  26.69 
 
 		 798 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.17 
 
 		 712 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  25.57 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  22.68 
 
 		 676 aa  73.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  23.01 
 
 		 781 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  25.42 
 
 		 807 aa  71.6  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.51 
 
 		 617 aa  71.2  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  26.32 
 
 		 790 aa  71.2  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  26.19 
 
 		 779 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  22.91 
 
 		 790 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  26.15 
 
 		 785 aa  70.1  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  22.63 
 
 		 781 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  27.13 
 
 		 745 aa  67  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  27.03 
 
 		 746 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  24.12 
 
 		 801 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  24.71 
 
 		 773 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  27.03 
 
 		 755 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  23.71 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  27.03 
 
 		 755 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  24.59 
 
 		 785 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  25.53 
 
 		 758 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  21.27 
 
 		 766 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  26.64 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  22.22 
 
 		 806 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  25.98 
 
 		 758 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  26.64 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  25.49 
 
 		 806 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  24.8 
 
 		 790 aa  62.4  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  22.67 
 
 		 855 aa  61.6  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  23.64 
 
 		 766 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  25 
 
 		 777 aa  60.8  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  23.26 
 
 		 766 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  22.27 
 
 		 855 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  24.9 
 
 		 634 aa  60.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  24.81 
 
 		 753 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  26.24 
 
 		 773 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  24.07 
 
 		 766 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  28.25 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  24.15 
 
 		 773 aa  58.2  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  23.26 
 
 		 766 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  21.62 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  22.71 
 
 		 766 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  22.71 
 
 		 766 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  24.42 
 
 		 756 aa  57  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.32 
 
 		 582 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  24.91 
 
 		 575 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  22.58 
 
 		 574 aa  56.2  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  22.57 
 
 		 754 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  22.06 
 
 		 798 aa  55.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  22.18 
 
 		 773 aa  55.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.43 
 
 		 691 aa  54.3  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  24.12 
 
 		 788 aa  54.3  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  25.19 
 
 		 762 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  25.19 
 
 		 753 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  24.84 
 
 		 669 aa  53.5  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  26.53 
 
 		 669 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  28.38 
 
 		 550 aa  53.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  25.19 
 
 		 753 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  22.57 
 
 		 754 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  25.17 
 
 		 669 aa  52  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  25.17 
 
 		 669 aa  52  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  25.72 
 
 		 774 aa  52.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  26.39 
 
 		 588 aa  51.6  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  27.84 
 
 		 807 aa  51.2  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.35 
 
 		 716 aa  51.2  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  26.21 
 
 		 541 aa  50.8  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  21.71 
 
 		 588 aa  50.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.01 
 
 		 690 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.01 
 
 		 690 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.01 
 
 		 690 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.01 
 
 		 690 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.63 
 
 		 691 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.06 
 
 		 690 aa  50.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  35.34 
 
 		 929 aa  47.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  23.55 
 
 		 852 aa  47.8  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>