274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1769 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  100 
 
 
729 aa  1493    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  62.97 
 
 
739 aa  947    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  66.98 
 
 
723 aa  1011    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  64.11 
 
 
722 aa  969    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  89.3 
 
 
723 aa  1352    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  40.41 
 
 
726 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  39.49 
 
 
773 aa  568  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  29.35 
 
 
787 aa  233  9e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  25.81 
 
 
619 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  38.85 
 
 
790 aa  167  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  36.66 
 
 
806 aa  167  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  36.07 
 
 
807 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.75 
 
 
676 aa  163  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  35.29 
 
 
806 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.01 
 
 
739 aa  144  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  22.32 
 
 
654 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  24.11 
 
 
669 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.25 
 
 
793 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  23.47 
 
 
791 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.22 
 
 
712 aa  120  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  23.52 
 
 
670 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  23.48 
 
 
832 aa  114  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  22.79 
 
 
782 aa  107  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  21.47 
 
 
785 aa  107  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  21.36 
 
 
799 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  25.92 
 
 
798 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  25.51 
 
 
798 aa  101  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  22.03 
 
 
777 aa  100  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  21.04 
 
 
781 aa  98.6  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.51 
 
 
938 aa  98.2  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.99 
 
 
617 aa  94.7  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.88 
 
 
927 aa  94  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  21.24 
 
 
791 aa  93.6  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  21.76 
 
 
781 aa  91.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  24.72 
 
 
807 aa  91.3  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  23.81 
 
 
659 aa  90.5  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  22.86 
 
 
1067 aa  89.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  22.08 
 
 
835 aa  87.8  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  28.06 
 
 
750 aa  87.4  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  23.14 
 
 
779 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  20.53 
 
 
667 aa  84.7  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  22.98 
 
 
646 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  20.18 
 
 
614 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  23.2 
 
 
798 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  26.1 
 
 
774 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.76 
 
 
929 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  21.65 
 
 
775 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  28.57 
 
 
766 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  28.31 
 
 
746 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  21.06 
 
 
822 aa  78.2  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  28.31 
 
 
755 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  28.31 
 
 
755 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  24.85 
 
 
766 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  24.65 
 
 
766 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  22.3 
 
 
588 aa  76.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  28.17 
 
 
766 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  23.06 
 
 
756 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  29.46 
 
 
790 aa  75.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.14 
 
 
934 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  28.45 
 
 
874 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  25.49 
 
 
649 aa  75.1  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  23.5 
 
 
692 aa  74.7  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.27 
 
 
966 aa  74.7  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  24 
 
 
790 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  25.93 
 
 
761 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.1 
 
 
934 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  26.57 
 
 
788 aa  74.3  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.22 
 
 
580 aa  74.3  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  27.94 
 
 
495 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  30.87 
 
 
745 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.27 
 
 
934 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  24.07 
 
 
855 aa  73.9  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  27.94 
 
 
431 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  26.69 
 
 
766 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  21.15 
 
 
852 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  26.69 
 
 
766 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  21.3 
 
 
753 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  21.01 
 
 
709 aa  72.8  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  23.44 
 
 
855 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  23.61 
 
 
773 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  27.38 
 
 
757 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  24.32 
 
 
754 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.33 
 
 
934 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.78 
 
 
934 aa  72  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.78 
 
 
934 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.78 
 
 
934 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.11 
 
 
944 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  25.39 
 
 
797 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.33 
 
 
934 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  27.31 
 
 
766 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  22.75 
 
 
639 aa  70.1  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.5 
 
 
674 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  24.03 
 
 
849 aa  70.5  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  24.57 
 
 
650 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.33 
 
 
934 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.33 
 
 
934 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  25 
 
 
650 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  19.2 
 
 
636 aa  68.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  26.14 
 
 
772 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  23.49 
 
 
841 aa  67.8  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>