More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2112 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 797 aa  1647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  66.17 
 
 		 798 aa  1091    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  65.79 
 
 		 798 aa  1082    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  69.57 
 
 		 807 aa  1145    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  31.01 
 
 		 785 aa  365  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  31.26 
 
 		 790 aa  363  6e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  32.65 
 
 		 774 aa  360  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  30.77 
 
 		 781 aa  346  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  30.59 
 
 		 781 aa  343  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  28.61 
 
 		 777 aa  321  3.9999999999999996e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  29.02 
 
 		 852 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  28.02 
 
 		 772 aa  259  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  29.65 
 
 		 773 aa  259  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  30.96 
 
 		 798 aa  259  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  28.68 
 
 		 753 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  28.2 
 
 		 753 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  28.52 
 
 		 762 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  28.86 
 
 		 785 aa  252  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  28.8 
 
 		 754 aa  249  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 756 aa  248  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  28.42 
 
 		 754 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  29.06 
 
 		 753 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  28.19 
 
 		 775 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  29.53 
 
 		 773 aa  246  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  30.78 
 
 		 758 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  27.68 
 
 		 779 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  29.59 
 
 		 758 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  27.92 
 
 		 761 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  29.96 
 
 		 773 aa  237  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  27.82 
 
 		 801 aa  236  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  31.48 
 
 		 755 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  31.48 
 
 		 746 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  31.45 
 
 		 755 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  27.15 
 
 		 788 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  27.77 
 
 		 750 aa  231  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  29.9 
 
 		 745 aa  225  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  28.88 
 
 		 757 aa  222  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  30.08 
 
 		 766 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  30.39 
 
 		 766 aa  219  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  29.92 
 
 		 766 aa  218  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  30.23 
 
 		 766 aa  217  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  30.39 
 
 		 766 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  30.39 
 
 		 766 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  26.12 
 
 		 790 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  25.67 
 
 		 855 aa  195  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  25.44 
 
 		 855 aa  193  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  30.57 
 
 		 495 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  38.99 
 
 		 874 aa  180  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  31.76 
 
 		 431 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  25.2 
 
 		 619 aa  172  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.77 
 
 		 588 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.24 
 
 		 676 aa  151  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.34 
 
 		 712 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  24.71 
 
 		 670 aa  142  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  26.9 
 
 		 654 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  24.78 
 
 		 669 aa  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  37.28 
 
 		 766 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25 
 
 		 617 aa  127  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  30.82 
 
 		 739 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.59 
 
 		 582 aa  105  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  21.47 
 
 		 634 aa  100  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.8 
 
 		 674 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  21.2 
 
 		 723 aa  96.3  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  29.62 
 
 		 790 aa  95.5  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  21.17 
 
 		 773 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  21.14 
 
 		 788 aa  92.8  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.01 
 
 		 722 aa  90.1  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.35 
 
 		 690 aa  89.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  24.24 
 
 		 806 aa  88.6  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  28.06 
 
 		 739 aa  88.2  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.08 
 
 		 574 aa  87.4  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  20.97 
 
 		 938 aa  87  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.63 
 
 		 806 aa  85.9  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.52 
 
 		 541 aa  84  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  24.48 
 
 		 917 aa  84  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  26.59 
 
 		 726 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.05 
 
 		 691 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  29.92 
 
 		 787 aa  81.6  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  29.71 
 
 		 723 aa  81.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  20.55 
 
 		 835 aa  80.9  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.05 
 
 		 692 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.9 
 
 		 692 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.29 
 
 		 691 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.86 
 
 		 832 aa  80.5  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  23.77 
 
 		 681 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  21.19 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  23.63 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  22.38 
 
 		 707 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  24.84 
 
 		 791 aa  78.2  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  21.84 
 
 		 580 aa  77.8  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  20.83 
 
 		 647 aa  77.4  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  23.64 
 
 		 647 aa  77.4  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  24.68 
 
 		 681 aa  76.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  22.69 
 
 		 639 aa  75.1  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  20.29 
 
 		 645 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.64 
 
 		 738 aa  73.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  25.78 
 
 		 729 aa  72.4  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  21.98 
 
 		 641 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.49 
 
 		 930 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  21.17 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>