More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2909 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  62.71 
 
 		 773 aa  901    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  65.01 
 
 		 762 aa  984    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  64.46 
 
 		 758 aa  994    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  92.61 
 
 		 761 aa  1447    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  58.19 
 
 		 755 aa  836    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  59.15 
 
 		 754 aa  924    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  100 
 
 		 775 aa  1598    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  58.79 
 
 		 766 aa  895    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  49.41 
 
 		 855 aa  766    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  62.12 
 
 		 766 aa  958    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  57.24 
 
 		 779 aa  909    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  57.8 
 
 		 746 aa  824    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  59.82 
 
 		 788 aa  912    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  70.78 
 
 		 772 aa  1120    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  53.46 
 
 		 785 aa  807    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  58.27 
 
 		 766 aa  884    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  54.14 
 
 		 790 aa  802    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  64.93 
 
 		 753 aa  1002    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  58.01 
 
 		 745 aa  848    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  62.5 
 
 		 801 aa  963    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  64.88 
 
 		 753 aa  984    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  58.61 
 
 		 754 aa  917    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  58.5 
 
 		 773 aa  896    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  49.76 
 
 		 855 aa  764    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  58.91 
 
 		 798 aa  871    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  58.22 
 
 		 766 aa  889    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  58.06 
 
 		 755 aa  833    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  64.61 
 
 		 773 aa  987    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  59.19 
 
 		 766 aa  900    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  64.35 
 
 		 758 aa  986    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  58.22 
 
 		 766 aa  889    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  57.31 
 
 		 757 aa  875    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  57.6 
 
 		 756 aa  912    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  58.53 
 
 		 766 aa  889    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  64.08 
 
 		 753 aa  989    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  48.34 
 
 		 750 aa  703    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  57.11 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  54.78 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  35.92 
 
 		 774 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  35.06 
 
 		 790 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  34.03 
 
 		 785 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  31.71 
 
 		 781 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.45 
 
 		 781 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  30.59 
 
 		 777 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  32.23 
 
 		 852 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  28.19 
 
 		 797 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  28.24 
 
 		 798 aa  242  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  27.8 
 
 		 807 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  27.63 
 
 		 798 aa  239  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  27.65 
 
 		 670 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.81 
 
 		 669 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  23.04 
 
 		 619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  35.97 
 
 		 874 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.46 
 
 		 676 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  26 
 
 		 654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.22 
 
 		 712 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25 
 
 		 588 aa  109  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.89 
 
 		 617 aa  107  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.44 
 
 		 574 aa  103  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.85 
 
 		 550 aa  97.1  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  24.08 
 
 		 580 aa  94.7  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  22.86 
 
 		 634 aa  89  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  27.61 
 
 		 773 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  27.02 
 
 		 739 aa  87.8  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  27.56 
 
 		 722 aa  84  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  20.57 
 
 		 726 aa  84.3  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  24.8 
 
 		 670 aa  82  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  26.72 
 
 		 643 aa  80.9  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  22.65 
 
 		 723 aa  77.4  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  25.76 
 
 		 790 aa  76.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  28.9 
 
 		 674 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  28.79 
 
 		 640 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  28.52 
 
 		 659 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.99 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  27.18 
 
 		 739 aa  74.7  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  28.52 
 
 		 659 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  24.19 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  22.51 
 
 		 791 aa  73.9  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  21.65 
 
 		 729 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  28.52 
 
 		 633 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  24.52 
 
 		 685 aa  73.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.62 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  24.51 
 
 		 652 aa  73.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.4 
 
 		 707 aa  73.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  25.08 
 
 		 754 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  28.41 
 
 		 669 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  23.78 
 
 		 658 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  22.54 
 
 		 691 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  28.41 
 
 		 669 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  28.41 
 
 		 640 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  24.8 
 
 		 664 aa  72  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  22.5 
 
 		 629 aa  72  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  23.05 
 
 		 723 aa  72  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.29 
 
 		 952 aa  71.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  23.1 
 
 		 641 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  24.79 
 
 		 683 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  24.89 
 
 		 699 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  23.91 
 
 		 676 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  24.18 
 
 		 690 aa  68.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 575 aa  68.2  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>