285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5813 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  56.12 
 
 		 762 aa  831    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  56.35 
 
 		 788 aa  840    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  61.78 
 
 		 766 aa  921    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  54.44 
 
 		 761 aa  843    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  52.05 
 
 		 785 aa  758    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  60.69 
 
 		 756 aa  953    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  62.23 
 
 		 855 aa  986    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  54.58 
 
 		 775 aa  855    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  61.96 
 
 		 755 aa  879    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  55.05 
 
 		 779 aa  854    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  61.52 
 
 		 746 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  55.27 
 
 		 772 aa  861    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  61.78 
 
 		 766 aa  931    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  60.88 
 
 		 745 aa  897    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  55.18 
 
 		 801 aa  850    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  61.37 
 
 		 754 aa  959    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  54.81 
 
 		 773 aa  815    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  61.83 
 
 		 755 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  61.9 
 
 		 766 aa  925    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  100 
 
 		 790 aa  1596    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  61.47 
 
 		 757 aa  919    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  57.53 
 
 		 758 aa  850    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  61.78 
 
 		 766 aa  920    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  57.4 
 
 		 758 aa  847    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  61.9 
 
 		 766 aa  925    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  60.48 
 
 		 754 aa  951    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  55.48 
 
 		 753 aa  833    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  56.71 
 
 		 766 aa  858    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  57.11 
 
 		 773 aa  828    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  55.85 
 
 		 753 aa  848    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  47.13 
 
 		 750 aa  682    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  56.51 
 
 		 753 aa  838    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  55.89 
 
 		 798 aa  818    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  56.89 
 
 		 773 aa  878    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  62.28 
 
 		 766 aa  927    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  62.5 
 
 		 855 aa  991    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  63.08 
 
 		 495 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  61.34 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  32.25 
 
 		 790 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  31.95 
 
 		 785 aa  429  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  31.66 
 
 		 781 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.41 
 
 		 781 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  32.41 
 
 		 774 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  30.21 
 
 		 777 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  28.27 
 
 		 852 aa  293  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  29.75 
 
 		 798 aa  233  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  29.19 
 
 		 798 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  28.78 
 
 		 807 aa  222  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  27 
 
 		 797 aa  220  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  27.52 
 
 		 874 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.12 
 
 		 676 aa  134  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  23.99 
 
 		 739 aa  120  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  29.06 
 
 		 669 aa  119  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  26.18 
 
 		 654 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.08 
 
 		 712 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  23.08 
 
 		 619 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  28.3 
 
 		 670 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  29.06 
 
 		 773 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25.38 
 
 		 588 aa  94.7  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  30.54 
 
 		 617 aa  94  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  30.55 
 
 		 790 aa  89  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  22.8 
 
 		 729 aa  89  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.38 
 
 		 723 aa  81.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  23.84 
 
 		 791 aa  80.9  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  35.96 
 
 		 806 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.41 
 
 		 634 aa  79  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  25.06 
 
 		 574 aa  76.6  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  32.33 
 
 		 722 aa  75.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  20 
 
 		 938 aa  75.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  30.54 
 
 		 723 aa  75.5  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  26.01 
 
 		 726 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  28.92 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  27.5 
 
 		 739 aa  69.7  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.28 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  21.29 
 
 		 669 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  21.55 
 
 		 580 aa  66.6  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  22.81 
 
 		 782 aa  65.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  22.98 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.33 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  21.12 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  20.73 
 
 		 550 aa  63.9  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  30.67 
 
 		 929 aa  63.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  30.46 
 
 		 917 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  25.95 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  26.34 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  25.95 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  24.73 
 
 		 669 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  25.95 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  27.84 
 
 		 807 aa  62  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  24.37 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  28.46 
 
 		 706 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  24.86 
 
 		 841 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  29.91 
 
 		 699 aa  59.7  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.89 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  29.52 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.81 
 
 		 929 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  25.04 
 
 		 690 aa  57.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  22.43 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  26.62 
 
 		 806 aa  57.4  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  37.2 
 
 		 681 aa  57.4  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>