262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3766 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  100 
 
 		 806 aa  1623    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  84.58 
 
 		 790 aa  1364    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  63.55 
 
 		 787 aa  1006    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  41.18 
 
 		 807 aa  535  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  42.63 
 
 		 806 aa  526  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.06 
 
 		 773 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  24.91 
 
 		 726 aa  168  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  38.64 
 
 		 723 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  35.95 
 
 		 729 aa  157  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  37.58 
 
 		 739 aa  152  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  35.6 
 
 		 723 aa  146  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  36.13 
 
 		 722 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  23.85 
 
 		 654 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.23 
 
 		 676 aa  105  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  32.47 
 
 		 798 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  22.95 
 
 		 670 aa  99.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  29.71 
 
 		 798 aa  99  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  28.01 
 
 		 619 aa  96.3  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  31.27 
 
 		 807 aa  96.3  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  25.85 
 
 		 774 aa  95.1  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  30.63 
 
 		 798 aa  92.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  28.84 
 
 		 669 aa  90.9  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.67 
 
 		 793 aa  89.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  28.22 
 
 		 781 aa  87.8  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  29.23 
 
 		 762 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 753 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  28.67 
 
 		 779 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  28.37 
 
 		 781 aa  85.5  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  27.71 
 
 		 753 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  26.74 
 
 		 777 aa  85.1  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  25.09 
 
 		 790 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  28.63 
 
 		 797 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  27.76 
 
 		 753 aa  84.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  28.77 
 
 		 766 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  36.25 
 
 		 756 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  29.15 
 
 		 745 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.07 
 
 		 712 aa  81.3  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  35.96 
 
 		 790 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  28.03 
 
 		 746 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  29.17 
 
 		 758 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  28.84 
 
 		 852 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  28.03 
 
 		 755 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  28.72 
 
 		 755 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  20.49 
 
 		 799 aa  79  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  29.79 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  28.95 
 
 		 773 aa  78.2  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  28.37 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  28.37 
 
 		 431 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  28.03 
 
 		 758 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  24.44 
 
 		 785 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 617 aa  75.1  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 773 aa  75.1  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  25.85 
 
 		 772 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  35.62 
 
 		 757 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  35.62 
 
 		 766 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  35.62 
 
 		 766 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  26.03 
 
 		 750 aa  73.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  27.02 
 
 		 754 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  28.03 
 
 		 773 aa  72.4  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  28.38 
 
 		 788 aa  72  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  35 
 
 		 766 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  35 
 
 		 766 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  36.42 
 
 		 855 aa  71.6  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  35 
 
 		 766 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  34.38 
 
 		 766 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  24.3 
 
 		 801 aa  70.1  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  35.8 
 
 		 855 aa  70.1  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  29.06 
 
 		 874 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  26.16 
 
 		 754 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  26.64 
 
 		 761 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  26.24 
 
 		 775 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  33.33 
 
 		 785 aa  65.1  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  24.53 
 
 		 791 aa  64.3  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  25 
 
 		 782 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.66 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.86 
 
 		 651 aa  62  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  34.11 
 
 		 788 aa  60.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  24.34 
 
 		 749 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.85 
 
 		 691 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.3 
 
 		 690 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.3 
 
 		 690 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  34.18 
 
 		 670 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.3 
 
 		 690 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  29.63 
 
 		 707 aa  58.9  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  27.81 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.3 
 
 		 690 aa  57.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 934 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.41 
 
 		 921 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.3 
 
 		 690 aa  57.4  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 934 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  29.41 
 
 		 645 aa  56.6  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 934 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  30 
 
 		 674 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.6 
 
 		 957 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  31.11 
 
 		 665 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  25.93 
 
 		 659 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  25.93 
 
 		 659 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.17 
 
 		 694 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.91 
 
 		 666 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.61 
 
 		 978 aa  56.2  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>