More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1104 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  55.31 
 
 		 669 aa  808    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  56.04 
 
 		 712 aa  794    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  52.75 
 
 		 654 aa  729    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 676 aa  1394    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  58.21 
 
 		 670 aa  825    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  32.68 
 
 		 739 aa  360  4e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  26.75 
 
 		 619 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  24.89 
 
 		 781 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.08 
 
 		 722 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  24.89 
 
 		 807 aa  160  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  23.61 
 
 		 739 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.85 
 
 		 781 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  23.13 
 
 		 723 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  25.46 
 
 		 729 aa  159  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  24.75 
 
 		 617 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  25.08 
 
 		 774 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 797 aa  151  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  24.5 
 
 		 723 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  23.94 
 
 		 785 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  26.75 
 
 		 798 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.25 
 
 		 726 aa  147  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  27.78 
 
 		 790 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  24.21 
 
 		 852 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  25.04 
 
 		 798 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  25.42 
 
 		 750 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  25.04 
 
 		 773 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  28.66 
 
 		 772 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  22.61 
 
 		 807 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  24.82 
 
 		 779 aa  132  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  28.73 
 
 		 785 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  27.31 
 
 		 745 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  24.72 
 
 		 855 aa  128  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  25.11 
 
 		 773 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  24.96 
 
 		 798 aa  128  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  27.06 
 
 		 755 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  25.23 
 
 		 777 aa  126  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25 
 
 		 588 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  25.07 
 
 		 855 aa  125  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  26.84 
 
 		 746 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  24.3 
 
 		 766 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  24.14 
 
 		 761 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  26.84 
 
 		 755 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  26.91 
 
 		 790 aa  124  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  25.76 
 
 		 801 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  23.71 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 753 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  26.3 
 
 		 495 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  27 
 
 		 753 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  26.41 
 
 		 758 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  27 
 
 		 756 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  24.07 
 
 		 754 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  26.09 
 
 		 431 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  26.55 
 
 		 754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  23.88 
 
 		 835 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 753 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  25.58 
 
 		 762 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  24.02 
 
 		 757 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  23.46 
 
 		 775 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  25.04 
 
 		 773 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  23.58 
 
 		 791 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  22.02 
 
 		 791 aa  114  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  25.97 
 
 		 758 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  30.41 
 
 		 790 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  23.64 
 
 		 766 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  23.64 
 
 		 766 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  27.07 
 
 		 788 aa  110  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  23.81 
 
 		 849 aa  110  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  23.45 
 
 		 766 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  23.45 
 
 		 766 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  31.52 
 
 		 787 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  23.33 
 
 		 938 aa  104  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  21.54 
 
 		 799 aa  105  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  23.23 
 
 		 874 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.52 
 
 		 806 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  21.64 
 
 		 788 aa  100  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  21.12 
 
 		 793 aa  100  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  23.47 
 
 		 841 aa  98.6  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  30.62 
 
 		 766 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  29.63 
 
 		 773 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.16 
 
 		 582 aa  95.5  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  29.84 
 
 		 766 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  27.95 
 
 		 806 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  27.79 
 
 		 749 aa  92.4  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  20.85 
 
 		 634 aa  91.3  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.19 
 
 		 694 aa  88.6  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.09 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.13 
 
 		 691 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.98 
 
 		 691 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  22.41 
 
 		 691 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  22.44 
 
 		 849 aa  81.3  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  21.9 
 
 		 1067 aa  79  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  22.47 
 
 		 646 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  23.51 
 
 		 646 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  21.94 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.91 
 
 		 703 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.87 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  20.71 
 
 		 669 aa  74.3  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  22.8 
 
 		 636 aa  73.9  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  22.68 
 
 		 782 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.45 
 
 		 691 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>