268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0823 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 739 aa  1507    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  65.26 
 
 		 723 aa  976    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  71.6 
 
 		 722 aa  1070    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  64.36 
 
 		 723 aa  943    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  62.97 
 
 		 729 aa  945    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  41.52 
 
 		 726 aa  588  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  41.58 
 
 		 773 aa  579  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  30.14 
 
 		 787 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.53 
 
 		 619 aa  167  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.61 
 
 		 676 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  35.43 
 
 		 807 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  38 
 
 		 790 aa  154  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  37.25 
 
 		 806 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  23.29 
 
 		 654 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  35.08 
 
 		 806 aa  145  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.35 
 
 		 712 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.66 
 
 		 669 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  23.69 
 
 		 670 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  20.27 
 
 		 793 aa  115  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  25.7 
 
 		 798 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  22.02 
 
 		 791 aa  105  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  23.37 
 
 		 1067 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  21.09 
 
 		 799 aa  100  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  22.27 
 
 		 782 aa  99.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  25.15 
 
 		 798 aa  99  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  20.71 
 
 		 777 aa  97.1  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  22.78 
 
 		 791 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  26.22 
 
 		 739 aa  92.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.8 
 
 		 927 aa  91.3  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  28.06 
 
 		 797 aa  88.2  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.7 
 
 		 617 aa  86.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  27.57 
 
 		 750 aa  86.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.21 
 
 		 934 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  26.77 
 
 		 785 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  26.06 
 
 		 790 aa  84.3  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  28.63 
 
 		 807 aa  84  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  26.3 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.21 
 
 		 934 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.45 
 
 		 541 aa  80.1  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  27.57 
 
 		 874 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  22.2 
 
 		 852 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  26.2 
 
 		 766 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  27.62 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  25.95 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.93 
 
 		 934 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.93 
 
 		 934 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  22.42 
 
 		 709 aa  77  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  20.58 
 
 		 667 aa  77  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  22.96 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  28.69 
 
 		 575 aa  75.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  25.27 
 
 		 758 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  27.18 
 
 		 775 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.69 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  22.89 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  26.57 
 
 		 758 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  23.37 
 
 		 756 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  26.92 
 
 		 773 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  23.41 
 
 		 798 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  22.09 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  26.85 
 
 		 761 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  27.17 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  26.23 
 
 		 772 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  26.94 
 
 		 745 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.19 
 
 		 674 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  25.7 
 
 		 753 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  23.24 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  30.63 
 
 		 706 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  27.16 
 
 		 785 aa  68.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  27.8 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  22.14 
 
 		 634 aa  68.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  21.19 
 
 		 835 aa  67.8  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  26.09 
 
 		 669 aa  67.8  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  28.69 
 
 		 757 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  27.71 
 
 		 779 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  25.94 
 
 		 773 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  25.2 
 
 		 762 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  25.2 
 
 		 753 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  25.36 
 
 		 669 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  23.97 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  27.8 
 
 		 766 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  27.8 
 
 		 766 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  27.8 
 
 		 766 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  27.8 
 
 		 766 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  28.51 
 
 		 790 aa  65.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  27.8 
 
 		 766 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.09 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  24.3 
 
 		 801 aa  64.3  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  26.04 
 
 		 669 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  25 
 
 		 746 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  26.01 
 
 		 669 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  28.69 
 
 		 1043 aa  63.5  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  25 
 
 		 755 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.11 
 
 		 957 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  27.39 
 
 		 766 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.11 
 
 		 938 aa  63.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  20.97 
 
 		 966 aa  63.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  28.34 
 
 		 849 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  25 
 
 		 755 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  20.97 
 
 		 639 aa  61.6  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  21.61 
 
 		 681 aa  61.2  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>