More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3036 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  58.78 
 
 		 788 aa  896    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  64.21 
 
 		 753 aa  967    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  58.48 
 
 		 754 aa  902    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  59.06 
 
 		 766 aa  890    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  64.21 
 
 		 762 aa  964    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  64.08 
 
 		 753 aa  981    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  54 
 
 		 790 aa  790    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  100 
 
 		 761 aa  1564    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  58.72 
 
 		 755 aa  835    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  52.79 
 
 		 785 aa  788    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  62.08 
 
 		 766 aa  942    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  92.61 
 
 		 775 aa  1447    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  56.79 
 
 		 779 aa  896    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  58.47 
 
 		 746 aa  824    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  71.08 
 
 		 772 aa  1117    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  64.4 
 
 		 773 aa  972    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  58.79 
 
 		 766 aa  885    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  64.93 
 
 		 758 aa  971    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  58.72 
 
 		 755 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  58.55 
 
 		 745 aa  847    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  48.24 
 
 		 855 aa  740    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  61.98 
 
 		 801 aa  950    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  58.08 
 
 		 754 aa  896    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  58.89 
 
 		 773 aa  889    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  48.59 
 
 		 855 aa  748    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  61.74 
 
 		 773 aa  885    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  58.62 
 
 		 766 aa  889    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  57.18 
 
 		 757 aa  867    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  59.45 
 
 		 766 aa  894    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  64.09 
 
 		 758 aa  965    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  58.53 
 
 		 798 aa  851    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  58.62 
 
 		 766 aa  889    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  58.79 
 
 		 766 aa  886    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  57.6 
 
 		 756 aa  900    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  63.99 
 
 		 753 aa  987    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  48.34 
 
 		 750 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  57.93 
 
 		 495 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  55.24 
 
 		 431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  35.79 
 
 		 774 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  34.78 
 
 		 790 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  34.56 
 
 		 785 aa  435  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  31.58 
 
 		 781 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.32 
 
 		 781 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  29.93 
 
 		 777 aa  393  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 852 aa  323  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  27.85 
 
 		 798 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  30.42 
 
 		 798 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  27.92 
 
 		 797 aa  238  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  28.46 
 
 		 807 aa  238  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.14 
 
 		 676 aa  124  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  23.98 
 
 		 619 aa  124  9e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  28.05 
 
 		 670 aa  121  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  35.06 
 
 		 874 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.57 
 
 		 669 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.05 
 
 		 712 aa  108  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25.71 
 
 		 588 aa  107  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  24.96 
 
 		 617 aa  105  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.42 
 
 		 654 aa  104  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  23.43 
 
 		 739 aa  103  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.13 
 
 		 574 aa  97.1  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  24.32 
 
 		 580 aa  92.4  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  26.6 
 
 		 773 aa  92  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.96 
 
 		 550 aa  89.7  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  28.57 
 
 		 722 aa  82  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.25 
 
 		 634 aa  79.7  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  24.05 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  26.62 
 
 		 790 aa  77  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  23.99 
 
 		 670 aa  75.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  26.07 
 
 		 723 aa  74.7  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  24.04 
 
 		 658 aa  74.3  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  22.34 
 
 		 541 aa  73.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  24.52 
 
 		 645 aa  72  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.92 
 
 		 787 aa  72  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.81 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  24.62 
 
 		 665 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  26.85 
 
 		 739 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  24.62 
 
 		 665 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  24.62 
 
 		 665 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  23.93 
 
 		 652 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  23.77 
 
 		 652 aa  70.1  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  25.64 
 
 		 643 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  25.59 
 
 		 729 aa  70.1  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  24.14 
 
 		 685 aa  69.3  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  21.41 
 
 		 707 aa  67.8  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  28.17 
 
 		 661 aa  67.8  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  27.97 
 
 		 674 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  27.9 
 
 		 641 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  22.74 
 
 		 629 aa  67.4  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  22.97 
 
 		 660 aa  67  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.52 
 
 		 952 aa  66.6  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  27.59 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  28.35 
 
 		 640 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  27.74 
 
 		 806 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  26.59 
 
 		 929 aa  65.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  20.49 
 
 		 849 aa  65.1  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  27.59 
 
 		 659 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  31.65 
 
 		 917 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  27.59 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  27.38 
 
 		 641 aa  64.7  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.41 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>