237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1180 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  58.03 
 
 		 753 aa  911    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  59.25 
 
 		 753 aa  904    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  59.12 
 
 		 762 aa  899    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  58.08 
 
 		 761 aa  896    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  57.72 
 
 		 788 aa  884    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  70.07 
 
 		 766 aa  1046    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  71.24 
 
 		 766 aa  1065    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  59.12 
 
 		 753 aa  910    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  59.81 
 
 		 766 aa  915    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  58.61 
 
 		 775 aa  917    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  57.73 
 
 		 779 aa  894    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  73.32 
 
 		 746 aa  1050    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  58.96 
 
 		 772 aa  924    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  70.2 
 
 		 766 aa  1053    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  73.06 
 
 		 745 aa  1095    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  57.16 
 
 		 801 aa  910    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  73.64 
 
 		 755 aa  1066    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  100 
 
 		 754 aa  1543    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  56.22 
 
 		 773 aa  852    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  70.59 
 
 		 766 aa  1053    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  61.12 
 
 		 790 aa  889    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  70.72 
 
 		 766 aa  1058    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  59.84 
 
 		 758 aa  909    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  70.59 
 
 		 766 aa  1053    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  60.21 
 
 		 758 aa  920    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  56.13 
 
 		 785 aa  823    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  70.5 
 
 		 757 aa  1051    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  73.28 
 
 		 495 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  75.43 
 
 		 756 aa  1191    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  48.34 
 
 		 750 aa  707    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  56.13 
 
 		 798 aa  823    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  60.44 
 
 		 773 aa  939    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  53.95 
 
 		 855 aa  828    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  54.06 
 
 		 855 aa  825    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  58.65 
 
 		 773 aa  845    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  94.16 
 
 		 754 aa  1462    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  73.38 
 
 		 755 aa  1063    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  71.46 
 
 		 431 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  34.51 
 
 		 774 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  33.68 
 
 		 790 aa  443  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  32.2 
 
 		 781 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.81 
 
 		 781 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  32.68 
 
 		 785 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  30.87 
 
 		 777 aa  416  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  31.97 
 
 		 852 aa  346  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  28.8 
 
 		 797 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  29.05 
 
 		 798 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  29.27 
 
 		 798 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  39.41 
 
 		 807 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  34.51 
 
 		 874 aa  124  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.07 
 
 		 676 aa  120  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.27 
 
 		 654 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  26.39 
 
 		 669 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  23.71 
 
 		 588 aa  111  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.67 
 
 		 712 aa  109  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  26.81 
 
 		 670 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  24.94 
 
 		 617 aa  102  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  26.98 
 
 		 619 aa  93.2  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25 
 
 		 582 aa  89.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  25.24 
 
 		 739 aa  87.4  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  20.53 
 
 		 550 aa  87.4  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.16 
 
 		 574 aa  86.3  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.08 
 
 		 773 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  23.61 
 
 		 575 aa  84  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  22.83 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  21.34 
 
 		 669 aa  80.1  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  21.29 
 
 		 669 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  21.18 
 
 		 669 aa  77.8  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  21.37 
 
 		 669 aa  77  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  20.4 
 
 		 726 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  25.66 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  26.17 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.93 
 
 		 580 aa  70.9  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  26.16 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  23.27 
 
 		 723 aa  65.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  20.77 
 
 		 634 aa  63.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  25.81 
 
 		 683 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  23.87 
 
 		 690 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.56 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.48 
 
 		 674 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  21.34 
 
 		 788 aa  62  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  23.12 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  25.53 
 
 		 665 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  25.53 
 
 		 665 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.27 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.17 
 
 		 787 aa  60.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  25.74 
 
 		 665 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  25.1 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  26.17 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  29.49 
 
 		 658 aa  57.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  24.95 
 
 		 699 aa  57  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  22.46 
 
 		 749 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.37 
 
 		 694 aa  56.2  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  24.37 
 
 		 691 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  23.72 
 
 		 699 aa  55.8  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  35.24 
 
 		 849 aa  55.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.22 
 
 		 934 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  26.29 
 
 		 664 aa  55.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  24.54 
 
 		 670 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 929 aa  55.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>