198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5309 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  59.28 
 
 		 762 aa  898    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  69.31 
 
 		 757 aa  1028    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  57.6 
 
 		 761 aa  900    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  59.15 
 
 		 753 aa  898    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  70.07 
 
 		 766 aa  1050    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  57.6 
 
 		 775 aa  912    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  58.44 
 
 		 779 aa  902    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  72.65 
 
 		 746 aa  1047    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  60.05 
 
 		 772 aa  956    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  69.32 
 
 		 766 aa  1044    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  72.25 
 
 		 745 aa  1084    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  75.03 
 
 		 754 aa  1181    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  57 
 
 		 801 aa  897    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  75.43 
 
 		 754 aa  1191    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  61.22 
 
 		 758 aa  929    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  56.8 
 
 		 773 aa  852    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 756 aa  1541    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  69.19 
 
 		 766 aa  1037    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  69.58 
 
 		 766 aa  1041    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  69.71 
 
 		 766 aa  1043    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  60.99 
 
 		 758 aa  920    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  69.19 
 
 		 766 aa  1037    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  59.25 
 
 		 753 aa  907    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  54.36 
 
 		 855 aa  850    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  49 
 
 		 750 aa  717    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  58.84 
 
 		 798 aa  867    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  60.55 
 
 		 773 aa  947    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  54.83 
 
 		 855 aa  855    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  58.54 
 
 		 753 aa  915    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  59.47 
 
 		 773 aa  864    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  60.43 
 
 		 790 aa  881    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  72.58 
 
 		 755 aa  1058    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  72.58 
 
 		 755 aa  1060    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  70.24 
 
 		 495 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  56.48 
 
 		 785 aa  827    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  59.42 
 
 		 766 aa  919    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  58.63 
 
 		 788 aa  889    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  68.68 
 
 		 431 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  36.35 
 
 		 774 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  32.55 
 
 		 781 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.89 
 
 		 781 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  33.68 
 
 		 790 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  32.77 
 
 		 777 aa  444  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  33.33 
 
 		 785 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  31.84 
 
 		 852 aa  350  7e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  30.12 
 
 		 798 aa  251  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 807 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 797 aa  248  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  29.34 
 
 		 798 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  36 
 
 		 874 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.6 
 
 		 669 aa  125  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  27 
 
 		 676 aa  120  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.12 
 
 		 712 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  21.88 
 
 		 619 aa  108  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  24.45 
 
 		 588 aa  105  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.96 
 
 		 617 aa  105  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  26.68 
 
 		 670 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  30.12 
 
 		 654 aa  103  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  30.3 
 
 		 739 aa  92  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  26.51 
 
 		 773 aa  91.3  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.77 
 
 		 723 aa  87.4  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  28.63 
 
 		 790 aa  86.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  36.25 
 
 		 806 aa  81.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  22.78 
 
 		 726 aa  81.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.07 
 
 		 574 aa  80.9  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.63 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  22.71 
 
 		 541 aa  77  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  23.06 
 
 		 729 aa  75.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  23.37 
 
 		 739 aa  73.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.91 
 
 		 787 aa  73.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  19.93 
 
 		 550 aa  73.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  21.31 
 
 		 788 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  21.74 
 
 		 723 aa  68.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.25 
 
 		 722 aa  68.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  19.62 
 
 		 669 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.24 
 
 		 580 aa  66.6  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  27.24 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  21.35 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  25.43 
 
 		 665 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  20.53 
 
 		 669 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  25.43 
 
 		 665 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  25.43 
 
 		 665 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.28 
 
 		 938 aa  63.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  20.34 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  23.23 
 
 		 749 aa  61.2  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  20.31 
 
 		 669 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  21.1 
 
 		 634 aa  60.1  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  29.63 
 
 		 670 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.63 
 
 		 706 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  24.59 
 
 		 674 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  24.44 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  29.05 
 
 		 692 aa  58.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  22.34 
 
 		 841 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  24.42 
 
 		 782 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.64 
 
 		 712 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  25.81 
 
 		 646 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  29.02 
 
 		 710 aa  56.6  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.19 
 
 		 666 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  20.96 
 
 		 636 aa  56.6  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  24.9 
 
 		 684 aa  56.6  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>