258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1186 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  72.98 
 
 		 766 aa  1070    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  61.72 
 
 		 766 aa  905    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  60.37 
 
 		 762 aa  880    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  59.34 
 
 		 753 aa  889    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  58.72 
 
 		 761 aa  875    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  100 
 
 		 755 aa  1509    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  99.07 
 
 		 431 aa  867    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  55.9 
 
 		 855 aa  837    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  58.19 
 
 		 775 aa  877    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  59.18 
 
 		 779 aa  883    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  99.73 
 
 		 746 aa  1489    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  58.75 
 
 		 772 aa  899    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  72.85 
 
 		 766 aa  1072    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  99.19 
 
 		 495 aa  991    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  94.1 
 
 		 745 aa  1380    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  60.37 
 
 		 753 aa  881    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  57.82 
 
 		 801 aa  899    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  73.64 
 
 		 754 aa  1129    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  73.8 
 
 		 754 aa  1127    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  59.63 
 
 		 773 aa  874    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  57.38 
 
 		 788 aa  863    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  72.39 
 
 		 757 aa  1054    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  73.11 
 
 		 766 aa  1066    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  57.73 
 
 		 785 aa  818    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  60.24 
 
 		 753 aa  887    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  72.72 
 
 		 766 aa  1064    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  61.17 
 
 		 758 aa  879    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  60.93 
 
 		 758 aa  880    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  73.11 
 
 		 766 aa  1066    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  99.47 
 
 		 755 aa  1501    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  50.33 
 
 		 750 aa  721    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  58.06 
 
 		 798 aa  821    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  61.15 
 
 		 773 aa  915    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  56.01 
 
 		 855 aa  844    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  73.24 
 
 		 766 aa  1071    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  61.1 
 
 		 773 aa  862    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  72.58 
 
 		 756 aa  1118    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  61.32 
 
 		 790 aa  857    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  35 
 
 		 774 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  32.68 
 
 		 790 aa  452  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  33.29 
 
 		 785 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  31.14 
 
 		 781 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  30.62 
 
 		 781 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  31.12 
 
 		 777 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  31.98 
 
 		 852 aa  351  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  31.06 
 
 		 798 aa  250  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  30.87 
 
 		 807 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  33.28 
 
 		 798 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  31.76 
 
 		 797 aa  243  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  35.69 
 
 		 874 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.04 
 
 		 676 aa  126  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.42 
 
 		 669 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  26.76 
 
 		 670 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.46 
 
 		 712 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.48 
 
 		 654 aa  107  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  27.32 
 
 		 739 aa  105  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  29.92 
 
 		 773 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.83 
 
 		 617 aa  101  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  24.96 
 
 		 588 aa  94  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  26.98 
 
 		 619 aa  90.5  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  28.73 
 
 		 790 aa  88.2  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  26.34 
 
 		 726 aa  87  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.45 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.37 
 
 		 806 aa  79.3  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  31.56 
 
 		 723 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  22.35 
 
 		 788 aa  74.7  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  27.94 
 
 		 729 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  28.98 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  26.96 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  30.36 
 
 		 722 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  20.13 
 
 		 550 aa  70.1  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  23.86 
 
 		 574 aa  69.7  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  21.73 
 
 		 793 aa  68.9  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.84 
 
 		 712 aa  68.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.47 
 
 		 723 aa  67.8  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.9 
 
 		 580 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  24.77 
 
 		 652 aa  65.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.69 
 
 		 934 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  27.03 
 
 		 782 aa  65.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  22.97 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.69 
 
 		 934 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  24.34 
 
 		 652 aa  64.3  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.6 
 
 		 938 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  26.46 
 
 		 643 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  25.57 
 
 		 669 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  25 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.3 
 
 		 934 aa  62.4  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  21.94 
 
 		 791 aa  62  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  25.56 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  26.54 
 
 		 674 aa  60.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  33.12 
 
 		 658 aa  60.1  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.55 
 
 		 666 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.86 
 
 		 694 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  25.56 
 
 		 669 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  28.77 
 
 		 684 aa  59.3  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  25.72 
 
 		 849 aa  58.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  25.19 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.51 
 
 		 934 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  27.91 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  31.88 
 
 		 917 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>