274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1361 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  57.05 
 
 		 753 aa  891    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  54.31 
 
 		 790 aa  791    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  57.12 
 
 		 756 aa  906    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  59.11 
 
 		 788 aa  894    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  58.41 
 
 		 755 aa  859    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  57.79 
 
 		 762 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  58.41 
 
 		 755 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  56.69 
 
 		 766 aa  876    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  61.98 
 
 		 761 aa  963    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  55.56 
 
 		 757 aa  858    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  57.77 
 
 		 753 aa  903    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  62.5 
 
 		 775 aa  977    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  55.82 
 
 		 779 aa  906    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  58.18 
 
 		 746 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  60.98 
 
 		 772 aa  956    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  56.67 
 
 		 766 aa  874    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  57.53 
 
 		 745 aa  887    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  100 
 
 		 801 aa  1644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  57.54 
 
 		 754 aa  921    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  56.42 
 
 		 766 aa  865    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  54.3 
 
 		 785 aa  816    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  56.25 
 
 		 773 aa  870    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  56.67 
 
 		 766 aa  870    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  59.51 
 
 		 766 aa  919    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  61.65 
 
 		 758 aa  943    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  56.82 
 
 		 766 aa  875    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  61 
 
 		 758 aa  940    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  57.16 
 
 		 754 aa  916    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  56.67 
 
 		 766 aa  870    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  49.94 
 
 		 855 aa  770    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  57.66 
 
 		 753 aa  888    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  48.9 
 
 		 750 aa  731    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  57.23 
 
 		 798 aa  848    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  70.49 
 
 		 773 aa  1108    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  49.59 
 
 		 855 aa  768    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  61.54 
 
 		 773 aa  899    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  57.31 
 
 		 495 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  54.67 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  33.08 
 
 		 790 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  33.33 
 
 		 774 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  32.83 
 
 		 785 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.76 
 
 		 781 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  31.76 
 
 		 781 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  29.87 
 
 		 777 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  29.96 
 
 		 852 aa  332  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  29.8 
 
 		 798 aa  263  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  29.08 
 
 		 798 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  29.05 
 
 		 807 aa  247  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  27.82 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.45 
 
 		 676 aa  126  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  35.18 
 
 		 874 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  24.66 
 
 		 669 aa  122  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.32 
 
 		 654 aa  114  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  26.43 
 
 		 670 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.12 
 
 		 712 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  26.16 
 
 		 617 aa  105  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  21.16 
 
 		 619 aa  102  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  24.75 
 
 		 588 aa  100  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  23.91 
 
 		 739 aa  90.5  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  27.88 
 
 		 790 aa  83.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  22.08 
 
 		 669 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  23.59 
 
 		 849 aa  77.8  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  24.21 
 
 		 773 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.48 
 
 		 793 aa  76.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  21.63 
 
 		 541 aa  75.9  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  26.57 
 
 		 788 aa  75.1  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  23.28 
 
 		 574 aa  73.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  25.52 
 
 		 726 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  28.19 
 
 		 580 aa  71.6  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  27.44 
 
 		 917 aa  70.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  21.28 
 
 		 550 aa  70.1  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  23.53 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  25.72 
 
 		 722 aa  68.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  30.19 
 
 		 806 aa  67.4  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  27.42 
 
 		 669 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  21.3 
 
 		 634 aa  67  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  24.12 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  22.81 
 
 		 614 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  27.02 
 
 		 669 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.88 
 
 		 723 aa  64.7  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  22.53 
 
 		 791 aa  64.7  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  24.63 
 
 		 787 aa  63.9  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  24.3 
 
 		 739 aa  63.9  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  22.54 
 
 		 588 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  25 
 
 		 799 aa  62.4  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  25.44 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  25.54 
 
 		 685 aa  62.4  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  26.24 
 
 		 644 aa  62  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  21.92 
 
 		 749 aa  60.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  21.77 
 
 		 583 aa  60.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  21.1 
 
 		 729 aa  60.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  21.99 
 
 		 582 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.02 
 
 		 929 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  26.85 
 
 		 929 aa  60.1  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  30.52 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  20.71 
 
 		 537 aa  60.1  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  28.98 
 
 		 658 aa  60.1  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.57 
 
 		 714 aa  60.1  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.97 
 
 		 720 aa  58.9  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  26.72 
 
 		 832 aa  58.9  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>