More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2947 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 774 aa  1600    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  50.64 
 
 		 785 aa  791    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  49.74 
 
 		 790 aa  791    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  40.44 
 
 		 777 aa  635  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  46.84 
 
 		 852 aa  631  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  41.44 
 
 		 781 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  40.8 
 
 		 781 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  36.35 
 
 		 756 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  35.79 
 
 		 761 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  35.74 
 
 		 753 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  35.92 
 
 		 775 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  35.56 
 
 		 753 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  36.1 
 
 		 762 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  35.32 
 
 		 773 aa  459  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  35.58 
 
 		 745 aa  459  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 753 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  36.46 
 
 		 758 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  35.13 
 
 		 788 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  34.81 
 
 		 772 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  36.26 
 
 		 758 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  34.41 
 
 		 779 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  35.17 
 
 		 754 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  34.51 
 
 		 754 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  36.18 
 
 		 766 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  35.82 
 
 		 785 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  35.93 
 
 		 773 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  34.93 
 
 		 773 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  35.13 
 
 		 755 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  34.77 
 
 		 766 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  34.77 
 
 		 766 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  34.64 
 
 		 766 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  35 
 
 		 755 aa  436  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  34.83 
 
 		 746 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  34.51 
 
 		 766 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  33.1 
 
 		 855 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  34.24 
 
 		 766 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  34.21 
 
 		 757 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  33.21 
 
 		 801 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  33.85 
 
 		 766 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  32.94 
 
 		 855 aa  425  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  33.2 
 
 		 750 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  33.93 
 
 		 798 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  32.32 
 
 		 790 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 797 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  31.05 
 
 		 807 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  31.86 
 
 		 798 aa  334  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  31.42 
 
 		 798 aa  323  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  34.61 
 
 		 495 aa  290  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  29.44 
 
 		 874 aa  278  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  34.33 
 
 		 431 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  25.93 
 
 		 619 aa  174  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  29.5 
 
 		 670 aa  165  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  29.01 
 
 		 654 aa  161  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.08 
 
 		 676 aa  154  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  28.12 
 
 		 669 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.43 
 
 		 588 aa  146  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  26.65 
 
 		 739 aa  144  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  27.66 
 
 		 712 aa  144  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.7 
 
 		 617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.63 
 
 		 582 aa  114  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.62 
 
 		 726 aa  112  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  24.26 
 
 		 575 aa  112  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  23.56 
 
 		 574 aa  109  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  27.89 
 
 		 790 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.06 
 
 		 634 aa  99  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  27.38 
 
 		 773 aa  98.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.27 
 
 		 541 aa  98.2  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.66 
 
 		 580 aa  96.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.02 
 
 		 722 aa  95.1  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  24.93 
 
 		 806 aa  95.1  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  21.47 
 
 		 641 aa  89  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  30.08 
 
 		 787 aa  88.6  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  21.46 
 
 		 723 aa  87.8  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.14 
 
 		 938 aa  87.4  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.03 
 
 		 723 aa  87  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  26.3 
 
 		 739 aa  83.2  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  23.07 
 
 		 661 aa  83.2  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  26.1 
 
 		 729 aa  81.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1544  helicase c2  25.85 
 
 		 635 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0592026  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  23.76 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  21.48 
 
 		 652 aa  76.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  24.04 
 
 		 675 aa  75.5  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  21.33 
 
 		 652 aa  75.1  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  24.05 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  21.82 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.61 
 
 		 927 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  21.28 
 
 		 917 aa  74.7  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  23.31 
 
 		 841 aa  73.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.69 
 
 		 692 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.63 
 
 		 934 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  23.17 
 
 		 681 aa  73.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.63 
 
 		 934 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.12 
 
 		 690 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.73 
 
 		 929 aa  72.4  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  25.12 
 
 		 643 aa  72  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  26.97 
 
 		 646 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.57 
 
 		 934 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.24 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.12 
 
 		 690 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.12 
 
 		 690 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>