More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0660 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 790 aa  1638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  44.11 
 
 		 852 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  49.74 
 
 		 774 aa  791    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  44.53 
 
 		 781 aa  683    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  44.4 
 
 		 781 aa  680    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  57.51 
 
 		 785 aa  959    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  40.75 
 
 		 777 aa  626  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  34.21 
 
 		 753 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 753 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  34.25 
 
 		 762 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  35.06 
 
 		 775 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 753 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 756 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  34.78 
 
 		 761 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  34.02 
 
 		 779 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  33.2 
 
 		 772 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  32.94 
 
 		 766 aa  452  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  33.51 
 
 		 773 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  32.96 
 
 		 801 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  33.68 
 
 		 754 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  34.55 
 
 		 758 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  33.38 
 
 		 754 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  35.04 
 
 		 758 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  33.2 
 
 		 745 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  34.63 
 
 		 773 aa  439  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  33.08 
 
 		 798 aa  439  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  34.04 
 
 		 785 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  32.9 
 
 		 766 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  32.85 
 
 		 773 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  32.65 
 
 		 766 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  33.16 
 
 		 766 aa  426  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  33.03 
 
 		 766 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  32.99 
 
 		 757 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  32.77 
 
 		 766 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  32.77 
 
 		 766 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  32.42 
 
 		 755 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  32.42 
 
 		 755 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  32.5 
 
 		 746 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  31.15 
 
 		 788 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  31.8 
 
 		 750 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  31.99 
 
 		 790 aa  402  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  28.37 
 
 		 855 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  28.84 
 
 		 855 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  31.26 
 
 		 797 aa  363  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 807 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  29.55 
 
 		 798 aa  340  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  29.19 
 
 		 798 aa  328  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  31.88 
 
 		 495 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  25.85 
 
 		 874 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  32.2 
 
 		 431 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  26.19 
 
 		 619 aa  157  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.26 
 
 		 588 aa  151  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  24.45 
 
 		 654 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.78 
 
 		 676 aa  147  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.73 
 
 		 669 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  23.92 
 
 		 739 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  24.17 
 
 		 670 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.61 
 
 		 712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.56 
 
 		 617 aa  127  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.27 
 
 		 582 aa  120  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.63 
 
 		 574 aa  118  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.53 
 
 		 580 aa  112  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  23.21 
 
 		 575 aa  106  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.27 
 
 		 722 aa  97.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  27.38 
 
 		 773 aa  92  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  23.8 
 
 		 669 aa  91.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  23.79 
 
 		 669 aa  91.3  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  26.49 
 
 		 790 aa  90.5  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.74 
 
 		 634 aa  89.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.48 
 
 		 723 aa  87.8  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  22.86 
 
 		 669 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  23.98 
 
 		 644 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.12 
 
 		 787 aa  85.5  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  24.09 
 
 		 645 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  25.95 
 
 		 726 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  25.09 
 
 		 806 aa  84.3  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  26.06 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.61 
 
 		 934 aa  84  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.61 
 
 		 934 aa  84  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.61 
 
 		 934 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.91 
 
 		 934 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.61 
 
 		 934 aa  84  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.61 
 
 		 934 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  23.35 
 
 		 647 aa  82.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.49 
 
 		 690 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  24.57 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.91 
 
 		 934 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.43 
 
 		 934 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  22.05 
 
 		 791 aa  80.9  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  22.46 
 
 		 691 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.9 
 
 		 691 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.04 
 
 		 708 aa  80.9  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  21.7 
 
 		 641 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.57 
 
 		 723 aa  80.1  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  24.36 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.51 
 
 		 690 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.63 
 
 		 690 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  22.02 
 
 		 641 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.51 
 
 		 690 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.48 
 
 		 690 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>