More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40350 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  64.34 
 
 		 762 aa  944    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  61.04 
 
 		 755 aa  842    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  63.67 
 
 		 753 aa  947    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  61.07 
 
 		 766 aa  888    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  62.57 
 
 		 753 aa  941    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  64.09 
 
 		 761 aa  978    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  59.97 
 
 		 754 aa  920    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  64.35 
 
 		 775 aa  997    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  58.99 
 
 		 757 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  59.71 
 
 		 779 aa  916    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  60.94 
 
 		 746 aa  834    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  66.98 
 
 		 772 aa  1040    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  60.03 
 
 		 766 aa  883    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  60.86 
 
 		 745 aa  868    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  51.3 
 
 		 855 aa  764    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  94.33 
 
 		 758 aa  1430    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  60.88 
 
 		 801 aa  937    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  65.51 
 
 		 766 aa  972    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  59.84 
 
 		 754 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  61.17 
 
 		 755 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  62.65 
 
 		 773 aa  937    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  64.21 
 
 		 753 aa  943    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  60.42 
 
 		 766 aa  880    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  57.14 
 
 		 790 aa  795    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  60.99 
 
 		 756 aa  933    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  61.07 
 
 		 766 aa  889    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  100 
 
 		 758 aa  1529    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  60.42 
 
 		 766 aa  880    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  55.81 
 
 		 785 aa  792    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  60.42 
 
 		 766 aa  883    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  63.77 
 
 		 773 aa  894    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  51.8 
 
 		 750 aa  744    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  59.9 
 
 		 798 aa  871    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  61.43 
 
 		 788 aa  909    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  64.4 
 
 		 773 aa  981    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  51.3 
 
 		 855 aa  762    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  59.63 
 
 		 495 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  56.98 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  36.38 
 
 		 774 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  34.55 
 
 		 790 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  34.61 
 
 		 785 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  33.68 
 
 		 781 aa  435  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  30.64 
 
 		 777 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  32.64 
 
 		 781 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  31.48 
 
 		 852 aa  321  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 807 aa  253  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  29.36 
 
 		 798 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  29.33 
 
 		 798 aa  248  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  29.73 
 
 		 797 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  37.45 
 
 		 874 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  26.1 
 
 		 669 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.41 
 
 		 676 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.81 
 
 		 654 aa  115  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.26 
 
 		 712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  26.51 
 
 		 617 aa  112  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.63 
 
 		 739 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  26.02 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  25.97 
 
 		 670 aa  99  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  25.31 
 
 		 619 aa  95.1  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  28.84 
 
 		 790 aa  87.8  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  21.61 
 
 		 550 aa  87  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.01 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  24.92 
 
 		 575 aa  80.5  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.33 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.7 
 
 		 580 aa  79.7  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  23.91 
 
 		 723 aa  75.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  26.57 
 
 		 739 aa  75.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  24.14 
 
 		 773 aa  75.1  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  22.2 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  26.14 
 
 		 765 aa  74.3  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  26.82 
 
 		 722 aa  74.3  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  30.08 
 
 		 661 aa  73.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.45 
 
 		 957 aa  70.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.62 
 
 		 806 aa  70.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  28.16 
 
 		 787 aa  69.7  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.24 
 
 		 929 aa  67  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  28.83 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  21.04 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  22.26 
 
 		 634 aa  65.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  26.61 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  26.21 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.16 
 
 		 934 aa  64.3  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 934 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 934 aa  63.9  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 934 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  25.81 
 
 		 669 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 934 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  26.24 
 
 		 782 aa  63.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.51 
 
 		 934 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  24.24 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  23.01 
 
 		 636 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.78 
 
 		 929 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  28.1 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  23.01 
 
 		 636 aa  62  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  24.62 
 
 		 729 aa  62  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.52 
 
 		 934 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  23.01 
 
 		 636 aa  62  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  23.01 
 
 		 636 aa  62  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  23.01 
 
 		 636 aa  62  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>