86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32894 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  100 
 
 		 1067 aa  2215    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  31.9 
 
 		 938 aa  382  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  32.73 
 
 		 791 aa  372  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  32.31 
 
 		 749 aa  358  3.9999999999999996e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  27.05 
 
 		 849 aa  240  9e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  26.68 
 
 		 849 aa  229  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  27.87 
 
 		 614 aa  218  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  24.86 
 
 		 841 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  24.26 
 
 		 791 aa  190  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  24.5 
 
 		 793 aa  184  8.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  24.66 
 
 		 799 aa  181  5.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  30.68 
 
 		 835 aa  162  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  28.88 
 
 		 788 aa  120  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  28.16 
 
 		 782 aa  117  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.95 
 
 		 722 aa  108  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  23.27 
 
 		 723 aa  103  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  23.64 
 
 		 739 aa  102  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  22.16 
 
 		 654 aa  90.5  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  22.86 
 
 		 729 aa  87  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  21.68 
 
 		 785 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  22.1 
 
 		 676 aa  79  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.73 
 
 		 669 aa  78.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  20.78 
 
 		 781 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  22.63 
 
 		 670 aa  76.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  20 
 
 		 781 aa  75.5  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  23.72 
 
 		 723 aa  74.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  21.56 
 
 		 574 aa  70.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.36 
 
 		 739 aa  70.1  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.36 
 
 		 773 aa  70.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  21.05 
 
 		 580 aa  69.3  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  20.86 
 
 		 712 aa  69.3  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  29.11 
 
 		 726 aa  67.4  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  23.71 
 
 		 790 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.55 
 
 		 582 aa  66.2  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  21.12 
 
 		 852 aa  65.1  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  20.22 
 
 		 774 aa  64.7  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  22.95 
 
 		 541 aa  64.3  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 634 aa  63.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  24.79 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  21.92 
 
 		 807 aa  62.4  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  20.29 
 
 		 777 aa  60.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  22.97 
 
 		 575 aa  61.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  27.62 
 
 		 619 aa  59.7  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  21.27 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  24.92 
 
 		 807 aa  55.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  22.22 
 
 		 745 aa  55.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  24.83 
 
 		 746 aa  55.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  24.83 
 
 		 755 aa  54.7  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  24.91 
 
 		 617 aa  55.1  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  24.83 
 
 		 755 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  24.15 
 
 		 495 aa  52.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  35.42 
 
 		 537 aa  52  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  24.15 
 
 		 431 aa  51.6  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  30.19 
 
 		 790 aa  51.2  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  28.26 
 
 		 674 aa  51.2  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  25.29 
 
 		 756 aa  51.6  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  21.23 
 
 		 754 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  31.3 
 
 		 806 aa  50.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  22.6 
 
 		 801 aa  50.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  29.41 
 
 		 583 aa  49.7  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 797 aa  50.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 706 aa  50.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  30.36 
 
 		 775 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  24.12 
 
 		 766 aa  48.9  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  24.12 
 
 		 766 aa  48.9  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  21.58 
 
 		 754 aa  48.9  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  25.95 
 
 		 917 aa  48.9  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  24.12 
 
 		 766 aa  48.5  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  36.17 
 
 		 798 aa  48.5  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  24.12 
 
 		 766 aa  48.5  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  36.17 
 
 		 798 aa  48.5  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  30.36 
 
 		 761 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.2 
 
 		 927 aa  48.1  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  23.76 
 
 		 785 aa  47.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  23.67 
 
 		 766 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  23.67 
 
 		 766 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  25.77 
 
 		 773 aa  48.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.79 
 
 		 787 aa  47.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  23.67 
 
 		 757 aa  47  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  21.79 
 
 		 846 aa  46.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  30 
 
 		 806 aa  46.2  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  29.17 
 
 		 588 aa  46.2  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  25.23 
 
 		 790 aa  45.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  27.62 
 
 		 537 aa  45.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  27.78 
 
 		 773 aa  45.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  29.47 
 
 		 466 aa  44.7  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>