161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0888 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  100 
 
 		 466 aa  965    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  25.58 
 
 		 583 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1524  helicase c2  34.02 
 
 		 657 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00208913 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0007  helicase c2  35.34 
 
 		 653 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000554419 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0015  helicase c2  34.91 
 
 		 655 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0747117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  25.06 
 
 		 644 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  29.27 
 
 		 640 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  24.17 
 
 		 588 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  29.1 
 
 		 614 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  20 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  21.4 
 
 		 636 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  21.35 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  21.69 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  21.35 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.78 
 
 		 921 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  21.35 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  21.48 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  21.48 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  23.44 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  21.43 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  21.48 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  21.48 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  21.48 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  21.48 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  26.16 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  21.48 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  21.48 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  23.18 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 934 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  22.5 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  20.25 
 
 		 646 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.64 
 
 		 929 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  20.76 
 
 		 639 aa  57  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1544  helicase c2  27.1 
 
 		 635 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0592026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  22.89 
 
 		 658 aa  56.6  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.51 
 
 		 934 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.51 
 
 		 934 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.51 
 
 		 934 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  22.22 
 
 		 670 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  25.83 
 
 		 641 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.37 
 
 		 944 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.51 
 
 		 934 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  23.27 
 
 		 807 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  21.65 
 
 		 636 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  21.24 
 
 		 634 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.95 
 
 		 927 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  26.14 
 
 		 641 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  20.77 
 
 		 634 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  21.17 
 
 		 639 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  21.26 
 
 		 636 aa  54.3  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  30.84 
 
 		 838 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  21.04 
 
 		 634 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  24.65 
 
 		 681 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.94 
 
 		 934 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.38 
 
 		 960 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.64 
 
 		 957 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.1 
 
 		 934 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  25.86 
 
 		 641 aa  53.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.97 
 
 		 934 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.9 
 
 		 934 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  28.02 
 
 		 709 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2617  helicase c2  26.97 
 
 		 668 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  30.53 
 
 		 685 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  23.53 
 
 		 669 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  23.53 
 
 		 640 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.1 
 
 		 956 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  24.2 
 
 		 669 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  23.53 
 
 		 669 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  20.16 
 
 		 639 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  27.7 
 
 		 843 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  25.7 
 
 		 929 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  28.33 
 
 		 876 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  25.94 
 
 		 665 aa  51.2  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  32.93 
 
 		 822 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  22.85 
 
 		 575 aa  50.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  30.21 
 
 		 729 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  23.11 
 
 		 640 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  23.17 
 
 		 633 aa  50.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  21.82 
 
 		 658 aa  50.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  25 
 
 		 629 aa  50.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  20.71 
 
 		 668 aa  50.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  23.17 
 
 		 659 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.28 
 
 		 954 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  23.17 
 
 		 659 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.66 
 
 		 708 aa  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  23.17 
 
 		 674 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  23.95 
 
 		 664 aa  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  22.42 
 
 		 636 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  19.92 
 
 		 651 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  27.64 
 
 		 662 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  28.17 
 
 		 668 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4486  helicase c2  28.42 
 
 		 714 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  19.53 
 
 		 634 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  20.55 
 
 		 647 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  34.57 
 
 		 909 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  21.68 
 
 		 639 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  28.23 
 
 		 849 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  29.52 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  29.52 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  29.52 
 
 		 647 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>