More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4486 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  53.3 
 
 		 658 aa  651    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  60.35 
 
 		 670 aa  786    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4486  helicase c2  100 
 
 		 714 aa  1402    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2617  helicase c2  58.83 
 
 		 668 aa  761    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3499  helicase c2  55.1 
 
 		 724 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  62.12 
 
 		 685 aa  816    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3242  helicase c2  56.82 
 
 		 740 aa  731    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  58.26 
 
 		 668 aa  775    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  50.57 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1900  helicase c2  53.62 
 
 		 688 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1828  helicase c2  53.19 
 
 		 688 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147958  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  41.31 
 
 		 713 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  39.89 
 
 		 743 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  41.23 
 
 		 754 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  39.89 
 
 		 725 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  39.94 
 
 		 725 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  39.3 
 
 		 755 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  39.29 
 
 		 658 aa  445  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  39.74 
 
 		 646 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  41.03 
 
 		 757 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  38.38 
 
 		 755 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  40.87 
 
 		 749 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1086  putative ATP-dependent helicase  40.99 
 
 		 752 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00956322  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1326  ATP-dependent helicase, putative  40.99 
 
 		 752 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0729389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2336  ATP-dependent helicase, putative  40.99 
 
 		 752 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2170  putative ATP-dependent helicase  41.14 
 
 		 752 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.779886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  38.33 
 
 		 751 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0081  putative ATP-dependent helicase  40.99 
 
 		 752 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1815  putative ATP-dependent helicase  40.99 
 
 		 752 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  36.6 
 
 		 651 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  39.68 
 
 		 651 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  38.18 
 
 		 639 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  39.68 
 
 		 643 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  36.02 
 
 		 646 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  39.26 
 
 		 639 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  37.99 
 
 		 707 aa  415  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  39.45 
 
 		 653 aa  415  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.79 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  37.88 
 
 		 668 aa  412  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  37.34 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  38.82 
 
 		 641 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  38.82 
 
 		 641 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  38.05 
 
 		 636 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  38.05 
 
 		 636 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  38.14 
 
 		 640 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  37.77 
 
 		 639 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  38.48 
 
 		 649 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  38.05 
 
 		 636 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  38.05 
 
 		 636 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  38.05 
 
 		 636 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  38.05 
 
 		 636 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  38.05 
 
 		 636 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  37.9 
 
 		 636 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  38.3 
 
 		 636 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  37.9 
 
 		 636 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  37.32 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  37.12 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  37.12 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  37.12 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  37.12 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  35.99 
 
 		 647 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  35.43 
 
 		 640 aa  395  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  34.28 
 
 		 646 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  34.3 
 
 		 644 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  38.43 
 
 		 634 aa  392  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  38.53 
 
 		 634 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  38.57 
 
 		 634 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  38.55 
 
 		 634 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  40.17 
 
 		 649 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  39.59 
 
 		 645 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  38.39 
 
 		 675 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  35.52 
 
 		 659 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  38.56 
 
 		 681 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  35.56 
 
 		 633 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  33.48 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  35.37 
 
 		 659 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  35.37 
 
 		 674 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  35.78 
 
 		 652 aa  372  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  35.77 
 
 		 652 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  34.64 
 
 		 646 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  37.11 
 
 		 649 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  37.92 
 
 		 664 aa  362  9e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  37.88 
 
 		 675 aa  362  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  37.88 
 
 		 675 aa  361  2e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  34.01 
 
 		 640 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  35.04 
 
 		 645 aa  355  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  36.99 
 
 		 660 aa  353  8e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  37.08 
 
 		 633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  37.05 
 
 		 633 aa  337  5e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  37.05 
 
 		 631 aa  336  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  37.36 
 
 		 635 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  31.7 
 
 		 674 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  33.05 
 
 		 659 aa  303  7.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.59 
 
 		 934 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  31.76 
 
 		 851 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  29.8 
 
 		 843 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  31.53 
 
 		 650 aa  273  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  31.29 
 
 		 650 aa  272  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  31.51 
 
 		 838 aa  263  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6284  helicase c2  42.86 
 
 		 749 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>