114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0007 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0007  helicase c2  100 
 
 		 653 aa  1335    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000554419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1524  helicase c2  94 
 
 		 657 aa  1258    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00208913 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0015  helicase c2  92.92 
 
 		 655 aa  1246    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0747117  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  23.24 
 
 		 640 aa  130  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  20.95 
 
 		 614 aa  127  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  35.34 
 
 		 466 aa  125  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  24.33 
 
 		 644 aa  96.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.25 
 
 		 832 aa  90.5  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  23.6 
 
 		 583 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  25.59 
 
 		 588 aa  87  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  20.97 
 
 		 929 aa  76.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.29 
 
 		 957 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  24.67 
 
 		 709 aa  69.7  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  24.74 
 
 		 667 aa  67.4  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.12 
 
 		 921 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  21.54 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  19.88 
 
 		 840 aa  64.7  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  20.53 
 
 		 641 aa  64.3  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  20.87 
 
 		 843 aa  63.9  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  19.11 
 
 		 944 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  20.12 
 
 		 651 aa  63.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  20.54 
 
 		 956 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  20.57 
 
 		 843 aa  60.8  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  21.69 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  20.41 
 
 		 930 aa  60.8  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  20.37 
 
 		 851 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.09 
 
 		 960 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  19.52 
 
 		 639 aa  58.9  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  21.71 
 
 		 830 aa  58.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  19.42 
 
 		 649 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  19.28 
 
 		 664 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  18.45 
 
 		 646 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0463  helicase c2  21.04 
 
 		 730 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0718718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  18.47 
 
 		 660 aa  54.7  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  19.2 
 
 		 665 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  19.25 
 
 		 921 aa  53.9  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  22.14 
 
 		 699 aa  53.5  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.36 
 
 		 720 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  23.62 
 
 		 876 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 706 aa  51.2  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  24.31 
 
 		 636 aa  50.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  19.04 
 
 		 633 aa  50.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  22.31 
 
 		 668 aa  50.8  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  19.91 
 
 		 707 aa  50.4  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  23.94 
 
 		 643 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  22.54 
 
 		 661 aa  50.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  21.92 
 
 		 664 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  24.02 
 
 		 634 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  25.77 
 
 		 653 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.92 
 
 		 934 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  23.46 
 
 		 636 aa  49.3  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.31 
 
 		 714 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  23.41 
 
 		 852 aa  48.5  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  24.33 
 
 		 830 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  25.51 
 
 		 646 aa  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  25.1 
 
 		 639 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  23.53 
 
 		 636 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  23.53 
 
 		 636 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  23.53 
 
 		 636 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  23.53 
 
 		 636 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  23.53 
 
 		 636 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  23.53 
 
 		 636 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  23.53 
 
 		 636 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  26.58 
 
 		 669 aa  47.4  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1300  helicase c2  24.89 
 
 		 645 aa  47.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1486  helicase c2  25.62 
 
 		 645 aa  47.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.530371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  25.1 
 
 		 644 aa  47.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  23.05 
 
 		 636 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1470  hypothetical protein  25 
 
 		 645 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1442  ATP-dependent helicase DinG  25.62 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1443  ATP-dependent helicase DinG  25 
 
 		 645 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  22.09 
 
 		 640 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1586  hypothetical protein  25 
 
 		 645 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  21.43 
 
 		 659 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.17 
 
 		 711 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  27.51 
 
 		 669 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.49 
 
 		 714 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  23.53 
 
 		 636 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  23.53 
 
 		 636 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  23.53 
 
 		 636 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  23.53 
 
 		 636 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3725  hypothetical protein  25.62 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0167806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1656  hypothetical protein  25.62 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.10694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.85 
 
 		 714 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1692  hypothetical protein  25 
 
 		 645 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  20.58 
 
 		 729 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  24.26 
 
 		 743 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.86 
 
 		 714 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.85 
 
 		 714 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  27.78 
 
 		 669 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  22.6 
 
 		 846 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  23.53 
 
 		 636 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1731  hypothetical protein  25.62 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000833443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1619  hypothetical protein  25.62 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  24.02 
 
 		 639 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  23.51 
 
 		 754 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  23.28 
 
 		 634 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.21 
 
 		 927 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  27.78 
 
 		 669 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  23.28 
 
 		 634 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>