More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12510 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  72.58 
 
 		 1085 aa  1494    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 1085 aa  1042    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 882 aa  855    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  52.37 
 
 		 887 aa  763    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 1137 aa  2244    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 393 aa  352  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 781 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  44.52 
 
 		 960 aa  312  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  37.48 
 
 		 824 aa  309  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  43.27 
 
 		 792 aa  308  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  37.11 
 
 		 907 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  42.81 
 
 		 1119 aa  306  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  44.72 
 
 		 886 aa  306  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.65 
 
 		 1125 aa  304  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  38.67 
 
 		 999 aa  303  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 775 aa  298  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.73 
 
 		 1092 aa  293  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  40.38 
 
 		 701 aa  290  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.63 
 
 		 1103 aa  290  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 1066 aa  289  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  36.19 
 
 		 799 aa  287  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  39.53 
 
 		 1141 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  44.97 
 
 		 1227 aa  283  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  39.35 
 
 		 969 aa  283  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  34.7 
 
 		 765 aa  282  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.79 
 
 		 1102 aa  281  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  38.59 
 
 		 1087 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.22 
 
 		 1017 aa  278  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  36.32 
 
 		 982 aa  277  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 814 aa  272  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 878 aa  267  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  40.28 
 
 		 760 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  40.77 
 
 		 678 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  38.74 
 
 		 1050 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.75 
 
 		 840 aa  262  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  39.16 
 
 		 950 aa  260  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  42.96 
 
 		 755 aa  259  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 1100 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.44 
 
 		 816 aa  258  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 952 aa  257  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 1058 aa  257  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  40.52 
 
 		 776 aa  254  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.56 
 
 		 1055 aa  254  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.81 
 
 		 1042 aa  254  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  41.46 
 
 		 1110 aa  251  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  37.87 
 
 		 921 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 957 aa  248  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  45.69 
 
 		 951 aa  245  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.53 
 
 		 1043 aa  244  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 877 aa  243  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  39.58 
 
 		 1060 aa  243  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  41.58 
 
 		 943 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 818 aa  237  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 1093 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  37.78 
 
 		 827 aa  234  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 1082 aa  234  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.87 
 
 		 1049 aa  234  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 1058 aa  234  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  40.55 
 
 		 658 aa  234  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  37.04 
 
 		 916 aa  234  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  40.2 
 
 		 1001 aa  232  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  40.37 
 
 		 1072 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 931 aa  231  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 972 aa  231  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 591 aa  230  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  41.08 
 
 		 1010 aa  230  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 601 aa  229  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 973 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10910  transcriptional regulator  61.84 
 
 		 285 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 901 aa  228  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 973 aa  228  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  39.95 
 
 		 1094 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 1097 aa  227  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 591 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  37.47 
 
 		 966 aa  225  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  40.29 
 
 		 601 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  40.29 
 
 		 601 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  40.1 
 
 		 1131 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  38.24 
 
 		 1064 aa  225  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 919 aa  224  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  45.03 
 
 		 1158 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  41.16 
 
 		 948 aa  221  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 973 aa  221  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  37.18 
 
 		 953 aa  221  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 948 aa  220  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 928 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 768 aa  218  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  39.2 
 
 		 780 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  40.77 
 
 		 980 aa  215  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  36.55 
 
 		 1014 aa  214  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 804 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2078  transcriptional regulator, LuxR family  43.8 
 
 		 940 aa  209  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.9735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 812 aa  207  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  32.79 
 
 		 777 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  41.77 
 
 		 1018 aa  206  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 1005 aa  206  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  42.82 
 
 		 1100 aa  206  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.97 
 
 		 1036 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 961 aa  206  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 888 aa  204  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>