More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1600 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  100 
 
 		 1071 aa  2065    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  32.7 
 
 		 1123 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  32.21 
 
 		 1114 aa  295  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.59 
 
 		 1150 aa  288  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  32.83 
 
 		 1121 aa  285  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  32.83 
 
 		 1123 aa  282  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  34.05 
 
 		 1132 aa  258  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  33.41 
 
 		 1118 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  30.26 
 
 		 1090 aa  255  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 1148 aa  248  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 1141 aa  228  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 1141 aa  228  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  32.8 
 
 		 1036 aa  228  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 1141 aa  228  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  31.99 
 
 		 1141 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 1118 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 1022 aa  207  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 1161 aa  185  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  30.82 
 
 		 1029 aa  171  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.95 
 
 		 957 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 1153 aa  154  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  37.81 
 
 		 1733 aa  154  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 1151 aa  154  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.97 
 
 		 1102 aa  154  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.32 
 
 		 965 aa  152  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.44 
 
 		 1055 aa  151  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  41.09 
 
 		 1017 aa  151  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  30.42 
 
 		 1054 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.68 
 
 		 969 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.78 
 
 		 1036 aa  149  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  35.11 
 
 		 1000 aa  149  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.58 
 
 		 1146 aa  147  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  35.17 
 
 		 388 aa  146  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 1198 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  40.25 
 
 		 1103 aa  144  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  38.49 
 
 		 489 aa  144  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.62 
 
 		 1125 aa  144  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 943 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 1003 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35.75 
 
 		 990 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 963 aa  141  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 1043 aa  140  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 943 aa  140  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  37.61 
 
 		 940 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.72 
 
 		 1092 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.94 
 
 		 1022 aa  139  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.08 
 
 		 1100 aa  138  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  37.23 
 
 		 1088 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 268 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  37.04 
 
 		 1108 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  38.3 
 
 		 960 aa  135  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  33.79 
 
 		 1186 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 1093 aa  134  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 1097 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 1015 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.71 
 
 		 496 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 1158 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 786 aa  131  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  40.16 
 
 		 655 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  31.98 
 
 		 921 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  41.13 
 
 		 611 aa  128  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.11 
 
 		 1339 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 1066 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 723 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 		 946 aa  127  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  40.08 
 
 		 954 aa  127  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.45 
 
 		 981 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  35.41 
 
 		 1018 aa  125  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.72 
 
 		 934 aa  126  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 983 aa  126  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.94 
 
 		 931 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36 
 
 		 622 aa  125  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  33.56 
 
 		 956 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  30.81 
 
 		 964 aa  124  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.54 
 
 		 992 aa  124  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.74 
 
 		 1030 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  38.58 
 
 		 378 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  28.31 
 
 		 1051 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.15 
 
 		 950 aa  121  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.62 
 
 		 1054 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.35 
 
 		 992 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  37.26 
 
 		 930 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 968 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.41 
 
 		 1227 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  35.47 
 
 		 833 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1010 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.2 
 
 		 1175 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  31.34 
 
 		 989 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 1013 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  34.77 
 
 		 267 aa  119  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  40.78 
 
 		 676 aa  119  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.51 
 
 		 631 aa  118  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  35.05 
 
 		 1699 aa  118  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  35.09 
 
 		 928 aa  118  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 654 aa  119  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  33.49 
 
 		 941 aa  118  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  32.75 
 
 		 453 aa  118  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  34.6 
 
 		 647 aa  117  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.63 
 
 		 921 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  29.98 
 
 		 1013 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>