269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1690 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  100 
 
 
2713 aa  5462    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  35.01 
 
 
3793 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  29.1 
 
 
1329 aa  292  7e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.41 
 
 
2402 aa  250  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  34.21 
 
 
1657 aa  219  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  28.2 
 
 
1547 aa  207  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  36.55 
 
 
1288 aa  188  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.1 
 
 
2270 aa  186  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  38.11 
 
 
1108 aa  184  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  29.41 
 
 
2262 aa  183  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.77 
 
 
1607 aa  181  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  27.83 
 
 
6497 aa  177  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  30.25 
 
 
1750 aa  154  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  36.02 
 
 
991 aa  154  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  28.46 
 
 
1969 aa  152  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  27.76 
 
 
1345 aa  147  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  24.66 
 
 
1804 aa  145  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  26.09 
 
 
5298 aa  140  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  29.86 
 
 
1064 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  28.09 
 
 
2024 aa  136  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.79 
 
 
1507 aa  136  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  25.59 
 
 
1624 aa  130  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  34.05 
 
 
1247 aa  128  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  24.02 
 
 
1100 aa  119  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  33.33 
 
 
1266 aa  118  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  26.45 
 
 
1463 aa  110  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  25.81 
 
 
874 aa  107  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  30.82 
 
 
2418 aa  105  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  27.49 
 
 
794 aa  103  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  29.81 
 
 
1748 aa  103  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  24.74 
 
 
5453 aa  102  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.28 
 
 
822 aa  102  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  24.6 
 
 
5544 aa  100  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  24.26 
 
 
1606 aa  100  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.95 
 
 
1585 aa  101  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  32.95 
 
 
1217 aa  100  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  24.48 
 
 
1163 aa  99.4  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  32.57 
 
 
1474 aa  98.6  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  29.65 
 
 
910 aa  98.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  26.25 
 
 
1059 aa  97.1  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1995  hypothetical protein  34.19 
 
 
239 aa  97.1  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00112898  normal  0.836416 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.58 
 
 
2367 aa  96.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  27.62 
 
 
561 aa  95.9  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.58 
 
 
2411 aa  95.9  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  28.63 
 
 
925 aa  94.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  26.09 
 
 
904 aa  94.4  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  25.83 
 
 
989 aa  94  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  27.22 
 
 
759 aa  93.6  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.14 
 
 
890 aa  92  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  25.05 
 
 
1620 aa  90.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.77 
 
 
1222 aa  90.1  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.64 
 
 
2402 aa  89.4  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.26 
 
 
1068 aa  88.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  39.68 
 
 
815 aa  87.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  31.87 
 
 
1002 aa  87.8  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  31.6 
 
 
799 aa  85.9  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  47.71 
 
 
2656 aa  86.3  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  24.97 
 
 
1602 aa  85.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  35.71 
 
 
1295 aa  85.9  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26.68 
 
 
2454 aa  85.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.12 
 
 
1673 aa  84.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  27.44 
 
 
2278 aa  84  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  24.66 
 
 
1672 aa  83.2  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.4 
 
 
2421 aa  82.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1464  hypothetical protein  32.08 
 
 
483 aa  82  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  32.48 
 
 
792 aa  79.7  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  31.19 
 
 
1170 aa  79.7  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  35.23 
 
 
801 aa  79.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5679  PKD domain containing protein  27.18 
 
 
511 aa  79  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.64 
 
 
1879 aa  78.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  28.53 
 
 
953 aa  78.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  24.89 
 
 
3794 aa  77.4  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  26.6 
 
 
2807 aa  77  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
1336 aa  75.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1456  hypothetical protein  30.85 
 
 
202 aa  73.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.1 
 
 
14944 aa  74.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  26.27 
 
 
1483 aa  73.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3600  hypothetical protein  30.2 
 
 
245 aa  73.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  24.92 
 
 
4429 aa  72.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  22.78 
 
 
1387 aa  71.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.59 
 
 
1079 aa  71.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  30.7 
 
 
483 aa  70.1  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  50.68 
 
 
440 aa  70.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  25.52 
 
 
749 aa  69.7  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  31.58 
 
 
1314 aa  69.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  23.68 
 
 
1139 aa  68.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  24.47 
 
 
2772 aa  68.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  26.47 
 
 
561 aa  67.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  31.37 
 
 
8918 aa  67  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.94 
 
 
752 aa  66.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  28.54 
 
 
1275 aa  66.6  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  31.71 
 
 
2251 aa  65.9  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  30.19 
 
 
3373 aa  65.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  27.04 
 
 
496 aa  65.9  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  26 
 
 
885 aa  65.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  24.91 
 
 
2489 aa  65.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  23.53 
 
 
1313 aa  65.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  33.56 
 
 
1989 aa  64.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  30.17 
 
 
918 aa  64.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  29.31 
 
 
1160 aa  64.3  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>