13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1995 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1995  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00112898  normal  0.836416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1456  hypothetical protein  44.97 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  34.19 
 
 		 2713 aa  97.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3600  hypothetical protein  33.48 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  34.18 
 
 		 4791 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  31.22 
 
 		 2251 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.75 
 
 		 2768 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.84 
 
 		 4220 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  31.61 
 
 		 16322 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4274  hypothetical protein  49.09 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000240713  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1335  hypothetical protein  75.86 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.128614  normal  0.0757331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  33.77 
 
 		 5442 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  40.7 
 
 		 4214 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>