More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4496 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  75.55 
 
 		 1168 aa  1584    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1031 aa  2093    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  37.04 
 
 		 1026 aa  579  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 1130 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 		 1026 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  34.79 
 
 		 1146 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1020 aa  541  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 1161 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1127 aa  529  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1013 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  36.16 
 
 		 1019 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 1037 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 1033 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1079 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  34.47 
 
 		 1006 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1039 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1181 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1164 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 		 1155 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1038 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1164 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 1144 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 1056 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1131 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1114 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1064 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1046 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1036 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 982 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 1050 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 1029 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1066 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  35 
 
 		 1023 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 996 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1012 aa  473  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1010 aa  476  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 1024 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1173 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 		 1034 aa  467  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 1020 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 1049 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1124 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1104 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1017 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1177 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1138 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1052 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1095 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1139 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1217 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1097 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1034 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1142 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 986 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1128 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 1038 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1062 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1132 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 1086 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 994 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1082 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1060 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.67 
 
 		 1041 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1117 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 1177 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 1189 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  32.88 
 
 		 1043 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 989 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1148 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1147 aa  446  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1122 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1071 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1116 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 979 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1051 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 1093 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1036 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1051 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 996 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1006 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1008 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1076 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1163 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1023 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1188 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1079 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1095 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1006 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1053 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1027 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1076 aa  433  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.19 
 
 		 1063 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1058 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1190 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1154 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1152 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1084 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1071 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 993 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1076 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>