More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1766 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  36.63 
 
 		 1132 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  36.01 
 
 		 1124 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 1161 aa  666    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1116 aa  2266    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  35.95 
 
 		 1114 aa  643    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  39.41 
 
 		 1037 aa  680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  36.52 
 
 		 1154 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  37.7 
 
 		 1128 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  39.07 
 
 		 1038 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.37 
 
 		 1177 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 		 1029 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  36.14 
 
 		 1097 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 1163 aa  612  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  35.22 
 
 		 1117 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 1154 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1152 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1150 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1129 aa  576  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  36.02 
 
 		 1041 aa  571  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  35.59 
 
 		 1059 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 1000 aa  568  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  37.07 
 
 		 1039 aa  569  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1066 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  36.43 
 
 		 1028 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  36.15 
 
 		 1023 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1051 aa  559  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1155 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1155 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1006 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 1019 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.77 
 
 		 1071 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  35.86 
 
 		 989 aa  542  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 1140 aa  539  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35.46 
 
 		 994 aa  539  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1122 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1077 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1148 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 982 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1147 aa  526  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1071 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1173 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1051 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 1154 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 996 aa  519  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1127 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 1050 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1010 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 986 aa  513  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  35.22 
 
 		 979 aa  509  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1102 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1076 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 1025 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1066 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1076 aa  503  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1008 aa  503  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 1038 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1198 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1013 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1023 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1076 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1087 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1181 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1081 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1096 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1039 aa  496  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1106 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 		 1023 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 1128 aa  493  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1116 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 1014 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1103 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 1144 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1079 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1172 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 		 1012 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 1026 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1017 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1023 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1079 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.45 
 
 		 1192 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1119 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 1043 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1096 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1023 aa  475  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1082 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 1033 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1060 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 999 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1028 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.92 
 
 		 1063 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1014 aa  464  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1080 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 1041 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  33.61 
 
 		 1085 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1021 aa  458  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 1008 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1027 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1036 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1109 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1036 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>