123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1469 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  100 
 
 		 1189 aa  2339    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  26.81 
 
 		 907 aa  170  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  25.66 
 
 		 1093 aa  140  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  27.8 
 
 		 918 aa  127  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  28.87 
 
 		 976 aa  121  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  28.87 
 
 		 976 aa  121  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  27.34 
 
 		 998 aa  121  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  27.32 
 
 		 1000 aa  120  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  27.32 
 
 		 1000 aa  120  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  26.69 
 
 		 968 aa  118  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  28.29 
 
 		 974 aa  118  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  26.81 
 
 		 1123 aa  116  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  27.32 
 
 		 1034 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  26.76 
 
 		 1100 aa  115  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  27 
 
 		 1039 aa  115  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  26.15 
 
 		 1107 aa  114  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.63 
 
 		 1536 aa  112  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  27.01 
 
 		 929 aa  111  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  27.97 
 
 		 1025 aa  110  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  26.76 
 
 		 982 aa  110  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  26.97 
 
 		 998 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  27.76 
 
 		 1034 aa  108  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  24.55 
 
 		 1100 aa  108  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  27.25 
 
 		 985 aa  108  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  28.09 
 
 		 1557 aa  108  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  27.11 
 
 		 952 aa  105  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.42 
 
 		 1098 aa  105  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  28.54 
 
 		 952 aa  105  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  26.11 
 
 		 1168 aa  104  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.99 
 
 		 1356 aa  103  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  27.48 
 
 		 1006 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  24.95 
 
 		 1102 aa  101  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.91 
 
 		 1102 aa  100  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  25.14 
 
 		 1102 aa  100  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.85 
 
 		 1538 aa  100  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.39 
 
 		 1098 aa  99.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  26.38 
 
 		 1107 aa  98.6  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25 
 
 		 1095 aa  97.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.75 
 
 		 1534 aa  91.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.85 
 
 		 1105 aa  89  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  24.3 
 
 		 1549 aa  85.9  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  27.03 
 
 		 814 aa  83.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  22.57 
 
 		 881 aa  80.9  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  24.16 
 
 		 1481 aa  77  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  23.03 
 
 		 961 aa  75.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  32.87 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  27.32 
 
 		 1976 aa  75.1  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  24.18 
 
 		 964 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  28.37 
 
 		 879 aa  73.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  25.1 
 
 		 946 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  25.79 
 
 		 945 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  34.31 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  30.89 
 
 		 1231 aa  68.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  25.83 
 
 		 944 aa  67  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  29.18 
 
 		 981 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  25.12 
 
 		 1014 aa  66.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  35.91 
 
 		 1175 aa  64.3  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  31.6 
 
 		 1967 aa  63.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1111 aa  62  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  21.03 
 
 		 1112 aa  61.6  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  27.88 
 
 		 982 aa  60.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  22.13 
 
 		 919 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.57 
 
 		 1245 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3692  TrwC relaxase  24.02 
 
 		 1068 aa  59.7  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.372056 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  27.85 
 
 		 1486 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0188  putative helicase  24.8 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  25.26 
 
 		 745 aa  59.3  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  24.31 
 
 		 1010 aa  58.9  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  23.44 
 
 		 1665 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  27.67 
 
 		 1184 aa  58.5  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3338  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1520 aa  57.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.389694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  25.44 
 
 		 910 aa  58.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  25.7 
 
 		 267 aa  56.6  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  23.99 
 
 		 943 aa  57  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4256  TrwC relaxase  31.72 
 
 		 1026 aa  56.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  22.91 
 
 		 698 aa  56.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  31.43 
 
 		 747 aa  55.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  32.92 
 
 		 637 aa  55.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  22.91 
 
 		 698 aa  55.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1013 aa  54.3  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  24.81 
 
 		 1683 aa  54.3  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  26.09 
 
 		 870 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  25.96 
 
 		 1176 aa  54.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  31.13 
 
 		 1980 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  29.3 
 
 		 936 aa  53.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  29.44 
 
 		 1035 aa  53.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.07 
 
 		 721 aa  52.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  31.82 
 
 		 957 aa  52.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  20.7 
 
 		 1170 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3587  exonuclease V subunit alpha  25.94 
 
 		 1699 aa  51.6  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  31.21 
 
 		 720 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  29.55 
 
 		 923 aa  51.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  26.97 
 
 		 1807 aa  50.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3619  exonuclease V subunit alpha  31.79 
 
 		 1082 aa  50.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  33.14 
 
 		 726 aa  49.7  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  24.61 
 
 		 717 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0587  AAA ATPase  24.61 
 
 		 717 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0593  AAA ATPase  24.61 
 
 		 717 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3226  aldehyde dehydrogenase  25.31 
 
 		 1681 aa  49.3  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  27.74 
 
 		 2090 aa  48.9  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>