More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06835 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  48.85 
 
 		 942 aa  842    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  100 
 
 		 914 aa  1853    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  44.15 
 
 		 958 aa  790    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  37.88 
 
 		 854 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  35.88 
 
 		 871 aa  482  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02635  hypothetical protein  24.73 
 
 		 954 aa  180  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0363772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0578  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 903 aa  152  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1168  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 939 aa  148  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 815 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 833 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  29.51 
 
 		 803 aa  113  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 793 aa  111  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  23.03 
 
 		 794 aa  103  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 791 aa  98.6  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 874 aa  93.6  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 716 aa  92.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 757 aa  87.8  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1094 aa  85.5  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 1105 aa  81.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 828 aa  81.3  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 720 aa  80.5  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 972 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  41.23 
 
 		 1017 aa  80.1  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1082 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 836 aa  79.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 1004 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1102 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 962 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  30.1 
 
 		 1080 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 759 aa  76.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 763 aa  74.3  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 882 aa  73.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  29.02 
 
 		 808 aa  73.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 828 aa  73.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 1049 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 998 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  28.04 
 
 		 979 aa  72.8  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 887 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 1034 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 1059 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 845 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 933 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  32.28 
 
 		 1030 aa  72.4  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  24.11 
 
 		 833 aa  71.6  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1062 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1038 aa  71.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 1003 aa  70.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  32.66 
 
 		 1095 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  26.91 
 
 		 1018 aa  69.7  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 866 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1095 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1095 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1128 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1022 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1068 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1062 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 1093 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1036 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 975 aa  68.6  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1057 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1202 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1051 aa  68.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1043 aa  68.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 1047 aa  67.8  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1034 aa  68.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 1001 aa  68.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1021 aa  67.8  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 929 aa  67.8  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1063 aa  67.8  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  29.85 
 
 		 1028 aa  67.8  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1040 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 691 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 922 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 1090 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 1008 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  30.05 
 
 		 1129 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 924 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1046 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 986 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 776 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 947 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 971 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 798 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1075 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1107 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 1023 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1101 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1059 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 815 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  29.79 
 
 		 735 aa  65.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1019 aa  65.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 854 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1138 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1051 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 756 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1071 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  24.58 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 999 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 1050 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>