More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0120 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  45.54 
 
 		 791 aa  681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 833 aa  1686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  50.87 
 
 		 815 aa  804    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  46.14 
 
 		 793 aa  724    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  46.68 
 
 		 716 aa  615  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  41.19 
 
 		 803 aa  600  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  39.97 
 
 		 794 aa  539  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 720 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 691 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 854 aa  161  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  28.38 
 
 		 942 aa  121  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  28.38 
 
 		 914 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 958 aa  107  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  23.72 
 
 		 871 aa  95.5  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 828 aa  92.8  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  27.76 
 
 		 799 aa  91.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 828 aa  89  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 798 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 791 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  27.2 
 
 		 797 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  27.13 
 
 		 782 aa  83.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 698 aa  82.4  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 735 aa  82.4  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 747 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  21.74 
 
 		 848 aa  79.7  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  22.18 
 
 		 795 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 945 aa  79  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 845 aa  77  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 768 aa  77  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 796 aa  76.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 		 788 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1117 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 836 aa  75.5  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 1001 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 1004 aa  75.1  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 946 aa  74.3  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 971 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 943 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  28.96 
 
 		 800 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 1175 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 866 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1107 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1075 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 760 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 787 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1021 aa  71.6  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 814 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 769 aa  72  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.92 
 
 		 833 aa  71.6  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 791 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1047 aa  70.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 982 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 759 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  26.39 
 
 		 808 aa  70.1  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1019 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 783 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 778 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 772 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 861 aa  70.1  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  28.71 
 
 		 1030 aa  68.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 721 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 972 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 988 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 955 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1120 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1033 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 730 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 893 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 753 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 775 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 922 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 806 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1062 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  26.92 
 
 		 1298 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 1049 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1043 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1161 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 634 aa  66.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  22.04 
 
 		 776 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1063 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1046 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 977 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1076 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 979 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1128 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1006 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 927 aa  65.1  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1153 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1095 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1041 aa  65.1  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 818 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 936 aa  64.7  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 821 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  25.73 
 
 		 726 aa  64.7  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1036 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 812 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 901 aa  64.3  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>