117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0230 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 420 aa  815    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  43.86 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  39.04 
 
 		 425 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  39.25 
 
 		 399 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  36.76 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  36.23 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  35.04 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  32.66 
 
 		 411 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  35.16 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  32.67 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  33.25 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  31.39 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  34.15 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  31.48 
 
 		 495 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  29.34 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  32.52 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  29.7 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  31.04 
 
 		 416 aa  93.2  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  28.84 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  28.18 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  45.45 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  28.4 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  43.16 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  28.54 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 558 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  42.68 
 
 		 681 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  25.84 
 
 		 520 aa  54.3  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  39 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  36.76 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  33.8 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  38.64 
 
 		 609 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  40.48 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 520 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  31.46 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 501 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 553 aa  50.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  32.37 
 
 		 538 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  52.17 
 
 		 498 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  38.03 
 
 		 562 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  33.68 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  37.04 
 
 		 543 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  34.71 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  34.26 
 
 		 525 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  33.65 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  38.18 
 
 		 602 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  34.83 
 
 		 665 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  36.56 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  32.68 
 
 		 522 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 553 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  32.28 
 
 		 525 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 517 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  37.66 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.16 
 
 		 501 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  35.71 
 
 		 555 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  29.41 
 
 		 487 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  36.05 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  38.03 
 
 		 540 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.14 
 
 		 601 aa  47  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 600 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  34.13 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  30.88 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  29.63 
 
 		 493 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  36.99 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 597 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  32.56 
 
 		 512 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  28.02 
 
 		 538 aa  46.6  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  39.44 
 
 		 648 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  32.35 
 
 		 554 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  32.35 
 
 		 554 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 659 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  32.35 
 
 		 554 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.92 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.48 
 
 		 740 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  37.65 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  37.21 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  35.23 
 
 		 619 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  28.47 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  34.15 
 
 		 557 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  40.74 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  26.32 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  35.11 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  36.62 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  35.21 
 
 		 637 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  35.14 
 
 		 627 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 549 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  44.64 
 
 		 561 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 547 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>