155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  100 
 
 		 411 aa  822    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  40.55 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  41.53 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 479 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  38.36 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  37.96 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  39.9 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  36.88 
 
 		 415 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  37.56 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  34.14 
 
 		 495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  34.17 
 
 		 395 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  33.89 
 
 		 447 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  33.42 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  33.59 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 414 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  31.02 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  33 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  29.92 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  29.93 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  30.2 
 
 		 419 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  28.06 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  32.66 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  42.36 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  25.46 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  26.87 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  43.28 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  43.28 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  43.28 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  25.25 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  50 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  28.3 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  48.33 
 
 		 538 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  44.83 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  45 
 
 		 529 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  42.42 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  34.69 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  31.29 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  25.52 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  37.41 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  48.28 
 
 		 515 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  48.28 
 
 		 515 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  48.28 
 
 		 515 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  42.67 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  24.67 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  45.16 
 
 		 522 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  39.19 
 
 		 547 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 502 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  34.44 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  35.14 
 
 		 498 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  34.81 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  48.15 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  44.83 
 
 		 537 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 563 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  32.17 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  45.9 
 
 		 485 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 739 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  33.99 
 
 		 502 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 552 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  34.62 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  24.88 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  44.07 
 
 		 510 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  32.43 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.83 
 
 		 540 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  47.27 
 
 		 498 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 468 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  44.44 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  43.94 
 
 		 611 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  24.87 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  21.59 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  36.46 
 
 		 535 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  34.16 
 
 		 501 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  38.6 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  38.6 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  38.36 
 
 		 609 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  38.6 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  34.38 
 
 		 616 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  42.37 
 
 		 514 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 493 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  36.21 
 
 		 740 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  40.51 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  32 
 
 		 495 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>