99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4482 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  750    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  62.77 
 
 		 395 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  58.25 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  55.47 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  45.45 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 464 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  36.75 
 
 		 495 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 429 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  37.63 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  34.81 
 
 		 409 aa  155  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  33.42 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  34.56 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  34.92 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  34.28 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  35.51 
 
 		 425 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  33.16 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  32.89 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  33.95 
 
 		 479 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  34.22 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  48.62 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  29.29 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  29.85 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  42.27 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  31.41 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  26.93 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  26.38 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  34.15 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  36.54 
 
 		 481 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  44.87 
 
 		 514 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 558 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  43.59 
 
 		 529 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  37.61 
 
 		 535 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  31.93 
 
 		 512 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  38.27 
 
 		 540 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  28.36 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  27.16 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  40.45 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  44.64 
 
 		 429 aa  49.7  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  42.86 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  41.43 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  24 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  56.52 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  40.7 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  42.86 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  42.86 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  42.86 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  27 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  48.21 
 
 		 530 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  41.1 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  43.96 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  29.27 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  27.74 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  32.67 
 
 		 520 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  42.11 
 
 		 554 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  42.11 
 
 		 554 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  42.11 
 
 		 554 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  44.44 
 
 		 510 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 563 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  40.32 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  39.8 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  36.05 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  42.11 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.1 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  43.86 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  36.05 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.89 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  26.11 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  31.29 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.28 
 
 		 562 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  30.49 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  38.54 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  28.46 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 486 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  36.47 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  44.44 
 
 		 514 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  39.06 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  37.21 
 
 		 425 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  37.18 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 502 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  38.37 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  41.38 
 
 		 515 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  41.38 
 
 		 515 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  41.38 
 
 		 515 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  34.88 
 
 		 393 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  43.33 
 
 		 460 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  32.35 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.05 
 
 		 459 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  31.17 
 
 		 547 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>