199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2134 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 394 aa  765    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  73.87 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  73.73 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  68.98 
 
 		 419 aa  498  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  65.78 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  54.23 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  51.94 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  53.97 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  53.6 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 425 aa  345  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  49.73 
 
 		 400 aa  344  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  53.25 
 
 		 420 aa  342  8e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  49.26 
 
 		 421 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  55.29 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  48.4 
 
 		 386 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  52.12 
 
 		 404 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  54.2 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  50.66 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  52.49 
 
 		 408 aa  315  8e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  52.49 
 
 		 473 aa  315  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  46.21 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  45.07 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  40.38 
 
 		 539 aa  269  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.87 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  47.86 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  44.27 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  40.43 
 
 		 429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  39.58 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  39.1 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  39.16 
 
 		 414 aa  245  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  39.52 
 
 		 428 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  39.52 
 
 		 428 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  39.47 
 
 		 428 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  44.12 
 
 		 453 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  46.1 
 
 		 276 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  45 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 494 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  33.52 
 
 		 246 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  43.55 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.55 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  24.18 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  24.18 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  24.18 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  24.18 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  48.53 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 517 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  23.77 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  29.1 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  30.43 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  55.81 
 
 		 431 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  35.37 
 
 		 478 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  44.26 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  35.14 
 
 		 515 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  35.14 
 
 		 515 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  35.14 
 
 		 515 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.88 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  27.61 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  47.27 
 
 		 529 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  32.5 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 597 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  23.36 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  26.12 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.63 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  25.47 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  28.81 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  28.21 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  35.48 
 
 		 563 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  32.93 
 
 		 554 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 372 aa  50.1  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  55.56 
 
 		 512 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  32.93 
 
 		 554 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  32.93 
 
 		 554 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  39.36 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  29.61 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 384 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  35.19 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  33.33 
 
 		 511 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  42.37 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  43.86 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  38.71 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  30.56 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.31 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1604  putative GAF sensor protein  41.18 
 
 		 631 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  34.15 
 
 		 525 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>