26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6541 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  31.9 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  32.69 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  33.77 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  35.09 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  31.91 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  31.82 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 425 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  29.88 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  34.74 
 
 		 419 aa  55.5  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  31.71 
 
 		 384 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 408 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  33.17 
 
 		 473 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 403 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  28.83 
 
 		 400 aa  49.3  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 408 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  26.45 
 
 		 539 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 414 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  32.32 
 
 		 426 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  35.87 
 
 		 421 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 479 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  34.74 
 
 		 397 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  30.29 
 
 		 428 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  28.3 
 
 		 418 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  32.57 
 
 		 429 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>