210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3509 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 392 aa  755    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  52.66 
 
 		 386 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  51.19 
 
 		 393 aa  359  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  51.85 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  52.67 
 
 		 419 aa  348  8e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  57.22 
 
 		 473 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  51.04 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  54.01 
 
 		 408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 408 aa  338  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  55.67 
 
 		 384 aa  335  9e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  53.99 
 
 		 425 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 403 aa  329  6e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  51.55 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  53.58 
 
 		 404 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  51.83 
 
 		 420 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  46.83 
 
 		 414 aa  316  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  53.6 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  50.13 
 
 		 397 aa  310  4e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  53.26 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  48.85 
 
 		 413 aa  306  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  46.97 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  50.95 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  45.7 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  49.6 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  44.36 
 
 		 539 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  43.8 
 
 		 418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  45.65 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  44.5 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  44.01 
 
 		 428 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 		 429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  42.86 
 
 		 414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  43.23 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  43.23 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  42.97 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 479 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  46.38 
 
 		 276 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  38.85 
 
 		 453 aa  92  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  28.61 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  36.36 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  39.06 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  19.89 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 305 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  54.17 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  29.88 
 
 		 246 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  39.33 
 
 		 616 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  36.84 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  34.57 
 
 		 611 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  52.73 
 
 		 529 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  31 
 
 		 417 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  30.96 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 537 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 553 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  41.54 
 
 		 486 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  47.54 
 
 		 515 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 517 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  36.25 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  47.54 
 
 		 515 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  47.54 
 
 		 515 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  36 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  27.76 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  34.38 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.62 
 
 		 540 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  36.14 
 
 		 485 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  35 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  31.58 
 
 		 648 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 558 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  40.4 
 
 		 681 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 665 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  16.47 
 
 		 313 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  50.91 
 
 		 522 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  43.55 
 
 		 511 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  39.73 
 
 		 530 aa  50.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  33.64 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  16.47 
 
 		 313 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  30 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  32.24 
 
 		 420 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  20.99 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  25.96 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  25.96 
 
 		 287 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  48.89 
 
 		 538 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  38.24 
 
 		 547 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  26.72 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  53.33 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  47.69 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  24.07 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.92 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  44.29 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  21.25 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  36.17 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  22.92 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.86 
 
 		 555 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  42.62 
 
 		 553 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>