249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3753 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  81.11 
 
 		 428 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  80.87 
 
 		 428 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  81.11 
 
 		 428 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  85.04 
 
 		 428 aa  685    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  75.25 
 
 		 414 aa  587  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  62.06 
 
 		 418 aa  487  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  63.16 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  51.54 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  50.51 
 
 		 393 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  41.22 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  44.68 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  41.76 
 
 		 414 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  43.93 
 
 		 392 aa  275  9e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  46.35 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  40.98 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  41.49 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  39.34 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  41.65 
 
 		 420 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  44.33 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  42.15 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  45.03 
 
 		 473 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  41.29 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  44.72 
 
 		 425 aa  249  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  40.15 
 
 		 539 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 425 aa  245  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  40.68 
 
 		 408 aa  243  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 403 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  42.44 
 
 		 373 aa  237  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  42.93 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  40.58 
 
 		 397 aa  233  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  41.99 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  39.1 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  38.89 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  42.76 
 
 		 276 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  48.57 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.31 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  38.97 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  47.54 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  47.62 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  47.76 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  28.57 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  47.62 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  47.62 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  44.71 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  30.29 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  34.93 
 
 		 637 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  45 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  42.68 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  40 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  36.67 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  36.67 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  36.67 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  27.27 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  36.67 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  28.57 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  45.9 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  58.7 
 
 		 538 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  42.55 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  41.38 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  53.49 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  47.37 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  41.03 
 
 		 547 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  41.79 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  38.61 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  33.17 
 
 		 514 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  46.67 
 
 		 540 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 563 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  28.67 
 
 		 600 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  46.03 
 
 		 418 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  37.68 
 
 		 525 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 552 aa  53.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  42.42 
 
 		 383 aa  53.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  43.55 
 
 		 485 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  48.33 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  30.22 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  34.75 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  54.35 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  38.81 
 
 		 540 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  40.62 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  30.54 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  40.38 
 
 		 558 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.62 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>